利用RNA-seq技术筛选影响文昌鸡腹脂沉积的重要候选基因 |
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引用本文: | 吴红芬,张颖,侯冠彧,王颖,汪刘浩,吴科榜,那威.利用RNA-seq技术筛选影响文昌鸡腹脂沉积的重要候选基因[J].中国畜牧杂志,2023(1):182-187. |
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作者姓名: | 吴红芬 张颖 侯冠彧 王颖 汪刘浩 吴科榜 那威 |
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作者单位: | 1. 海南大学动物科技学院;2. 中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所 |
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基金项目: | 2019年海南省基础与应用基础研究计划高层次人才项目(2019RC101); |
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摘 要: | 本研究利用RNA-seq技术筛选影响文昌鸡腹脂沉积的重要候选基因,旨在为低脂文昌鸡的分子育种提供理论依据。本研究结果显示,共有15 996个基因在文昌鸡腹部脂肪组织中表达,16 926个基因在儋州鸡腹部脂肪组织中表达,15 580个基因在文昌鸡和儋州鸡腹部脂肪组织中均有表达,95个基因在文昌鸡和儋州鸡腹部脂肪组织中差异表达。GO富集分析结果显示差异表达基因显著富集在细胞过程、分子活性物质运输等过程(P<0.05)。KEGG富集分析结果显示,差异表达基因在PPAR信号通路、TGF-β信号通路、不饱和脂肪酸的生物合成等途径富集。通过筛选与验证,最后确定SCD、SMOC1、IGFBP2、MSMB基因为影响文昌鸡腹脂沉积的重要候选基因。
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关 键 词: | 文昌鸡 腹脂沉积 RNA-seq 差异表达基因 候选基因 |
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