大白、长白和杜洛克猪多品种多性状一步法基因组选择准确性分析

种猪企业在实际育种中会面临单个品种（例如杜洛克）数据量稀少的情况，利用其他品种数据量的优势，将品种作为固定效应可以提升育种值估计准确率。此外，多性状一步法可以利用性状间的遗传联系提升育种值计算的准确率，也被企业视作重要的育种方法。本研究以大白、长白和杜洛克猪为研究对象，分析多性状一步法（ssGBLUP）与单性状一步法育种值预测的准确率，以及多品种联合计算与单品种独立计算育种值预测的准确率。研究包括3个品种、5个生长性状和3个繁殖性状以及超过8 000头的芯片数据，利用BLUPF90+软件计算育种值以及标准误差（SE）。结果表明，对于生长性状和繁殖性状，多性状在ssGBLUP、GBLUP和BLUP方法上的育种值准确率均优于单性状3%～15%；当参考群数量<500头时，多品种联合计算能获得比单品种独立计算更高的育种值准确率。表明在实际育种中，单品种数据量小于500头时，可以采用多品种联合计算育种值，随着数据量增大到1 000头时，应该切换回单品种独立计算；在算法和算力满足的情况下，多性状在育种值准确性上优于单性状。