浙江省近年甲型H1N1流感病毒神经氨酸酶基因序列分析 |
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引用本文: | 陈寅,茅海燕,周敏,李榛,严菊英,张严峻,卢亦愚.浙江省近年甲型H1N1流感病毒神经氨酸酶基因序列分析[J].疾病监测,2013,28(10):811-814. |
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作者姓名: | 陈寅 茅海燕 周敏 李榛 严菊英 张严峻 卢亦愚 |
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作者单位: | 浙江省疾病预防榨制中心.浙江杭州310051 |
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基金项目: | 浙江省重点科技创新团队计划(No.2011R50021);浙江省医药卫生科技计划(No.2013KYB054);浙江省公共卫生检验检测重点学科群资助(No.XKQ-009-003) |
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摘 要: | 目的 分析浙江省2009 2013年初甲型H1N1流感病毒神经氨酸酶基因(NA)序列进化特征。 方法 提取浙江省2009 2013年初29株甲型H1N1流感病毒基因组RNA,反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)扩增NA基因,测序并拼接出ORF。以浙江省不同年份与地域15份代表性毒株NA序列和GenBank数据库中选取的22株2009 2012年国内外甲型H1N1流感病毒NA基因序列,采用MEGA 5.1软件对其进行序列比对并构建种系发生树。 结果 扩增并测序获得29株甲型H1N1流感病毒的NA基因ORF的全长序列,与国内外甲型H1N1流感病毒NA序列比对后显示序列的同源性较高,浙江省毒株与北美早期甲型H1N1流感病毒典型代表株A/California/04/2009(H1N1)的同源性为98.20%~99.50%,其中采集于2012年末和2013年初的4份病毒NA与A/California/04/2009(H1N1)的同源性为98.63%~99.14%。在1株采集于2010年1月的甲型H1N1流感病毒NA的基因序列中发现可导致奥司他韦耐药的H275Y突变基因型。 结论 虽然浙江省后期的甲型H1N1流感病毒神经氨酸酶基因累积了更多的变异,但所有毒株之间基因同源性仍然较高,所有毒株的神经氨酸酶基因同源性达到98.20%及以上,序列分析结果证实1份毒株携带奥司他韦耐药基因型突变。
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关 键 词: | 甲型H1N1流感病毒 神经氨酸酶 序列分析 种系发生树 |
收稿时间: | 2013-08-02 |
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