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海洋线虫Litoditis marina低氧胁迫响应的转录组分析
引用本文:李博,谢玉素,张留所.海洋线虫Litoditis marina低氧胁迫响应的转录组分析[J].海洋与湖沼,2023,3(3):786-798.
作者姓名:李博  谢玉素  张留所
作者单位:中国科学院海洋研究所 中国科学院实验海洋生物学重点实验室 山东 青岛 266071;青岛海洋科学与技术试点国家实验室海洋生物学与生物技术功能实验室 山东 青岛 266237;中国科学院海洋大科学研究中心 山东 青岛 266071;中国科学院大学 北京 100049
基金项目:国家重点研发项目,2018YFD0901301号;青岛创业创新领军人才项目,Grant16-8-3-19-zhc号;中国科学院海洋大科学研究中心重点部署项目,2019.11~2022.11
摘    要:全球气候变化导致海洋氧含量降低,海水低氧胁迫对海洋无脊椎动物的生长、发育和繁殖造成了严重的威胁。以海洋线虫Litoditis marina为实验对象,观察了其在不同氧浓度(21%、3%、1%和0.5%)条件下的生长发育速率,并对不同氧浓度条件下的L1幼虫样品进行了转录组测序和分析。实验结果表明,当环境氧浓度从21%下降至3%时, L. marina的发育成熟速度明显加快,进一步下降至1%时,产卵时间延长并和21%氧浓度接近,但当氧浓度为0.5%时,L.marina的产卵时间显著延迟。比较转录组分析表明,相比于21%氧浓度环境, 3%、1%和0.5%低氧条件下L. marina的糖酵解、糖异生、硫代谢和线粒体碳代谢等通路相关基因的表达显著上调;而寿命调控通路、细胞色素P450代谢通路和ABC转运蛋白相关基因的表达显著下调。研究结果发现的海洋线虫应对氧浓度胁迫的基因表达变化模式,为深入理解海洋无脊椎动物应答低氧胁迫分子机制提供了重要参考。

关 键 词:海洋线虫  Litoditis  marina  低氧胁迫  糖酵解  硫代谢  碳代谢通路
收稿时间:2022/9/1 0:00:00
修稿时间:2022/10/24 0:00:00

TRANSCRIPTOME ANALYSIS OF THE RESPONSE OF MARINE NEMATODE LITODITIS MARINA TO HYPOXIA STRESS
LI Bo,XIE Yu-Su,ZHANG Liu-Suo.TRANSCRIPTOME ANALYSIS OF THE RESPONSE OF MARINE NEMATODE LITODITIS MARINA TO HYPOXIA STRESS[J].Oceanologia Et Limnologia Sinica,2023,3(3):786-798.
Authors:LI Bo  XIE Yu-Su  ZHANG Liu-Suo
Affiliation:CAS Key Laboratory of Experimental Marine Biology, Institute of Oceanology, Chinese Academy of Sciences, Qingdao 266071, China;Laboratory for Marine Biology and Biotechnology, Pilot National Laboratory for Marine Science and Technology(Qingdao), Qingdao 266237, China;Center for Ocean Mega-Science, Chinese Academy of Sciences, Qingdao 266071, China;University of Chinese Academy of Sciences, Beijing 100049, China
Abstract:
Keywords:marine nematode  Litoditis marina  hypoxia stress  glycolysis  sulfur metabolism  carbon metabolism pathway
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