| 松材线虫与拟松材线虫hsp70和hsp90基因结构特征及其分子进化 |
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| 引用本文： | 许剑涛,黄麟,叶建仁.松材线虫与拟松材线虫hsp70和hsp90基因结构特征及其分子进化[J].南京林业大学学报(自然科学版),2015,39(1):11-16. |
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| 作者姓名： | 许剑涛 黄麟 叶建仁 |
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| 作者单位： | 南方现代林业协同创新中心,江苏省有害生物入侵预防与控制重点实验室,南京林业大学林学院,江苏南京210037 |
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| 基金项目： | “十二五”国家科技支撑计划，江苏高校优势学科建设工程资助项目 |
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| 摘 要： | 转录组的多态性是探讨物种多样性与分子进化的重要方面。笔者选取物种间保守性较高的HSP70、HSP90蛋白作为研究对象,探讨二者在松材线虫和拟松材线虫基因组中的结构差异,探明他们在松材线虫和拟松材线虫中的特点,并试图揭示两种线虫的系统发育关系。结果表明二者内含子具有丰富的多态性,内含子中的G+C含量也显著不同。核酸序列gABG和gmc2分别编码松材线虫和拟松材线虫HSP70的642个氨基酸,相似性高达99%,仅存在9个氨基酸的差异,并且这种差异是由13个碱基的多态性造成的。gABO和gmc19分别编码松材线虫和拟松材线虫的HSP90,其氨基酸序列相似性为92%。对同义密码子的偏好性分析表明,17种氨基酸对应的58个密码子中,gABG和gmc2存在10个密码子差异,gABO和gmc19存在5个密码子差异。采用邻接法分别构建的系统进化树表明松材线虫与拟松材线虫hsp70和hsp90在系统发育关系上最为接近,并与其他线性动物门物种高度同源。
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| 关 键 词： | 松材线虫 拟松材线虫 多态性 同义密码子 分子进化 |
The gene structural character and molecular evolution of hsp70 and hsp90 in Bursaphelenchus xylophilus and B.mucronatus |
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| XU Jiantao,HUANG Lin,YE Jianren.The gene structural character and molecular evolution of hsp70 and hsp90 in Bursaphelenchus xylophilus and B.mucronatus[J].Journal of Nanjing Forestry University(Natural Sciences ),2015,39(1):11-16. |
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| Authors: | XU Jiantao HUANG Lin YE Jianren |
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| Affiliation: | XU Jiantao;HUANG Lin;YE Jianren;Collaborative Innovation Center of Sustainable Forestry in Southern China, Jinangsu Province Key Laboratory for Prevention and Management of Invasive Species, College of Forestry, Nanjing Forestry University; |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Bursaphelenchus xylophilus B mucronatus polymorphism synonym codon molecular evolution |
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