基于线粒体COI和D-loop序列的黑龙江流域蛇(鱼句)种群遗传结构分析 |
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引用本文: | 胡宗云,杨培民,宋红梅,牟希东.基于线粒体COI和D-loop序列的黑龙江流域蛇(鱼句)种群遗传结构分析[J].淡水渔业,2023(2):12-20. |
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作者姓名: | 胡宗云 杨培民 宋红梅 牟希东 |
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作者单位: | 1. 辽宁省淡水水产科学研究院辽宁省水生动物病害防治重点实验室;2. 中国水产科学研究院珠江水产研究所农业农村部休闲渔业重点实验室 |
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摘 要: | 以线粒体COI和D-loop序列为分子标记,基于88个样本研究了黑龙江流域3个蛇(鱼句)(Saurogobio dabryi)种群的遗传多样性和遗传结构。结果表明,比对剪切后的COI和D-loop序列长度分别为582~583 b、834~583 b,基于COI序列总体的单倍型多样性(0.377 3)略低于基于D-loop序列的单倍型多样性(0.577 0),但基于两个序列总体的核苷酸多样性指数相等,且仅有0.000 9。群体间遗传距离分别为0.000 9(COI)和0.000 9~0.001 0(D-loop),群体间遗传分化指数分别为-0.004 9~0.007 6(COI)和-0.002 8~0.011 4(D-loop),遗传分化均不显著(P>0.05)。分子方差分析(AMOVA)显示,群体内遗传变异占总变异的100.02%(COI)和99.49%(D-loop),总的遗传变异主要源自群体内。单倍型系统发育树和TCS网络图表明,所有的单倍型随机地聚集在一起,没有形成明显的地理格局。中性检验和核苷酸错配分析显示,3个蛇(鱼句)群体历史上发生过种群扩张事件。综上,3个蛇(鱼句)...
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关 键 词: | 蛇(鱼句)(Saurogobio dabryi) COI D-loop 遗传多样性 遗传结构 |
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