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| 急性病毒性坏死病毒魁蚶株IAP-86基因全长cDNA克隆和生物信息学分析 | |
| 作者姓名： | 张 帅 王崇明 岳志芹 宋晓玲 白昌明 尹伟力 黄 倢 |
| 作者单位： | 1. 农业部海洋渔业可持续发展重点实验室 中国水产科学研究院黄海水产研究所 青岛 266071 2. 山东出入境检验检疫局检验检疫技术中心 青岛 266002 |
| 基金项目： | 现代农业产业技术体系建设专项，国家质检总局科研项目(2013IK040)共同资助。 |
| 摘 要： | 为深入探讨急性病毒性坏死病毒(Acute Viral Necrosis Virus, AVNV)魁蚶株的致病机理以及IAP-86蛋白的功能，从感染 AVNV 的濒死魁蚶外套膜中提取总 RNA，反转录获得 cDNA。根据 NCBI公布的 AVNV 全基因组序列中 ORF86序列设计两对反向套式引物，通过 cDNA 末端快速扩增(RACE)技术获得 ORF865￠端和3￠端的非编码区，拼接获得全长 cDNA 序列。Blast 序列比对显示，该基因与牡蛎疱疹病毒的同源性为100%，与栉孔扇贝 AVNV 的同源性为99%，并存在重叠基因。生物信息学分析预测，该蛋白不含信号肽，不存在跨膜区，最大疏水指数为1.800，最小疏水指数为–3.456。该蛋白存在8个潜在的磷酸化位点(包括5个丝氨酸、1个苏氨酸和2个酪氨酸)，存在 1个潜在的 O-糖基化位点，不存在潜在的 N-糖基化位点；其抗原表位主要集中在8?11、14?16、28?39、75?76、88?95、97?100和147?158位氨基酸。推测该株病毒可能为牡蛎疱疹病毒的变异株，并且基因重叠在该类病毒进化过程中可能扮演重要角色。 |
| 关 键 词： | 急性病毒性坏死病毒 魁蚶 细胞凋亡抑制蛋白 cDNA 末端快速扩增技术 生物信息学 |
| 收稿时间： | 2014/2/28 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2014/4/13 0:00:00 |
Full Length cDNA Cloning and Bioinformatics Analysis of Acute Viral Necrosis Virus IAP-86 Gene From Anadara uropygimelana |
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| Authors: | ZHANG Shuai WANG Chongming YUE Zhiqin SONG Xiaoling BAI Changming YIN Weili HUANG Jie |
| Abstract: | |
| Keywords: | Acute viral necrosis virus Anadara uropygimelana Inhibitor of apoptosis protein RACE Bioinformatics analysis |
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