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紫花苜蓿R2R3-MYB亚家族鉴定与干旱胁迫下的表达分析
引用本文:任明辉,张雨蓬,许涛,朱慧森,岑慧芳.紫花苜蓿R2R3-MYB亚家族鉴定与干旱胁迫下的表达分析[J].草地学报,2023,31(4):972-983.
作者姓名:任明辉  张雨蓬  许涛  朱慧森  岑慧芳
作者单位:山西农业大学草业学院, 山西 太谷 030801
基金项目:国家自然科学基金(32071872,31402131);山西省中央引导地方科技发展资金项目(YDZJSX2022B006);山西省基础研究计划青年科学研究项目(20210302124607);山西省高等学校科技创新项目(2021L106)资助
摘    要:MYB(v-myb avian myeloblastosis viral oncogene homolog)家族是最大的转录因子家族之一,R2R3-MYB亚家族在植物胁迫响应、次级代谢、生长和发育等过程发挥重要作用。本研究利用紫花苜蓿(Medicago sativa‘Zhongmu No.1’)基因组和转录组数据,通过生物信息学方法鉴定了R2R3-MYB转录因子,并对其序列特征、系统进化、染色体分布、基因结构、顺式作用元件及干旱胁迫下的表达模式进行分析。结果显示,紫花苜蓿中有121个R2R3-MYB亚家族成员,各成员均具有两个典型的MYB结构域,理化性质变化较大。系统进化分析将121个成员分为33个组,各成员无规律地定位在8条染色体上。基因结构和顺式作用元件分析发现,同一分组具有相同或相似的外显子数和顺式作用元件。响应干旱胁迫表达模式分析和实时荧光定量PCR(qRT-PCR)结果表明干旱胁迫下MsMYB12,MsMYB45,MsMYB52,MsMYB73,MsMYB88,MsMYB124,MsMYB149,MsMYB189,MsMYB268基因的表达量显著上调,可作为后期紫花苜蓿响应干...

关 键 词:紫花苜蓿  R2R3-MYB  生物信息学分析  干旱胁迫  表达模式
收稿时间:2022-10-08

Identification and Expression Analyses of R2R3-MYB Subfamily in Alfalfa under Drought Stress
REN Ming-hui,ZHANG Yu-peng,XU Tao,ZHU Hui-sen,CEN Hui-fang.Identification and Expression Analyses of R2R3-MYB Subfamily in Alfalfa under Drought Stress[J].Acta Agrestia Sinica,2023,31(4):972-983.
Authors:REN Ming-hui  ZHANG Yu-peng  XU Tao  ZHU Hui-sen  CEN Hui-fang
Affiliation:College of Grassland Science, Shanxi Agricultural University, Taigu, Shanxi Province 030801, China
Abstract:
Keywords:Alfalfa  R2R3-MYB  Bioinformatic analysis  Drought stress  Expression patterns  
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