| 山西省HIV-1主要流行株外膜蛋白env基因gp120区变异特性的研究 |
| |
| 引用本文： | 乔晓春,邢辉,申俊萍,宋艳辉,卫军,阮玉华,郭晓黎,宁少萍,邵一鸣.山西省HIV-1主要流行株外膜蛋白env基因gp120区变异特性的研究[J].中国艾滋病性病,2008,14(6). |
| |
| 作者姓名： | 乔晓春 邢辉 申俊萍 宋艳辉 卫军 阮玉华 郭晓黎 宁少萍 邵一鸣 |
| |
| 作者单位： | 乔晓春,申俊萍,郭晓黎(山西省疾病预防控制中心,太原,030012);邢辉,宋艳辉,阮玉华,邵一鸣(中国疾病预防控制中心性病艾滋病预防控制中心,北京,100050);卫军,宁少萍(运城市疾病预防控制中心,山西,运城,044000) |
| |
| 基金项目： | 国家高技术研究发展计划(863计划)，国家科技攻关项目 |
| |
| 摘 要： | 目的 研究山西省艾滋病病毒Ⅰ型(HIV-1)主要流行株env基因gp120区变异特性及其分子流行病学的意义.方法 应用套式聚合酶链反应(Nested-PCR)对山西省56份HIV-1毒株的gp120区进行扩增,使用ABI测序仪测序,应用BLAST、GCG和MEGA等序列分析软件,对gp120区序列进行分析.结果 山西省HIV-1主要流行株在系统进化树上与国际参考株B.CN.RLA2_U71182汇聚在一起.山西省56份HIV-1毒株gp120区的共享序列与同源性较高的国际参考株B.CN.RL42_U71182相比,N-糖基化位点增加了5个,并在V1-V5、C2、C3、C5区段存在独特的特征性氨基酸位点.V3顶端四肽存在着9种类型:GPGQ(39.29%)、GPGR(19.64%)、GPGK(17.86%)、GQGR(10.71%)、GLGR(5.36%),GQGQ、GPGA、RLRR与RPRK分别为1.79%.结论 在山西省HIV感染者中,HIV-1主要流行株仍为B'亚型,其HIV感染者中流行毒株的基因变化较大,gp120基因N-糖基化位点的增加和特征性氨基酸的存在,以及多种V3顶端四肽的存在,表明在较长的流行时间里已经有形成自己独特的序列特征模式的倾向.
|
| 关 键 词： | 艾滋病病毒Ⅰ型 亚型 N-糖基化位点 特征性氨基酸 |
Analysis of the variation of HIV-1 env gene gp120 region in Shanxi province of China |
| |
| QIAO Xiao-Chun,XING Hui,SHEN Jun-ping,et al..Analysis of the variation of HIV-1 env gene gp120 region in Shanxi province of China[J].Chinese JOurnal of Aids & STD,2008,14(6). |
| |
| Authors: | QIAO Xiao-Chun XING Hui SHEN Jun-ping |
| |
| Affiliation: | QIAO Xiao-Chun,XING Hui,SHEN Jun-ping,et al.(Shanxi Provincial Centre for Disease Prevention , Control,Taiyuan,Shanxi 030012,China) |
| |
| Abstract: | Objective To analyze the variation of HIV-1 env gene gp120 region in Shanxi province of China and the significance of its molecular epidemiology. Method gp120 full-length sequences of provirus DNA extracted from 56 HIV-1 positive blood samples were amplified by nested-PCR,and were sequenced by ABI3100 auto sequencer and the sequences were analyzed by BLAST,GCG and MEGA soft wares. Results HIV-1 strains circulationg in Shanxi province were assembled with reference strain B.CN.RL42-U71182 in the phylogenetic ... |
| |
| Keywords: | HIV-1 Subtype N-linked glycosylation Characteristic amino acids |
| 本文献已被 CNKI 万方数据 等数据库收录！ |
|
