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microRNA层面上癌症的公共机制
引用本文:肖雪,李霞,张绍军.microRNA层面上癌症的公共机制[J].生物物理学报,2009,25(1):43-50.
作者姓名:肖雪  李霞  张绍军
作者单位:1. 首都医科大学生物医学工程学院,北京 100069;
2. 哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院,哈尔滨 150081
基金项目:国家自然科学基金项目(30571034;30370798; 30871394),国家863项目(2007AA02Z329),973前期项目(2008CB517302); 2006年北京市新世纪百千万人才工程, 北京市教育委员会科技发展计划项目(KM200610025011)
摘    要:microRNAs(miRNA)是一类内源性的非编码小RNA。已有研究表明miRNAs的靶基因中有不少癌症的相关基因。为了全面研究miRNA与癌症的关系,作者将19种癌症的相关基因集合分别富集到494个miRNAs靶基因集合上,得到各类癌症所富集的miRNAs。结果发现19种癌症仅集中地富集在144个miRNAs上,由此验证了癌症在miRNAs上的公共机制。在此基础上,作者对癌症富集较多的8个miRNAs做了进一步研究,结果发现这8个miRNAs均为高度保守的miRNAs,且它们的靶基因集合一致富集在基因本体论(gene ontology,GO)的基本生物学过程上,并与转录因子活性以及蛋白激酶活性相关。另一方面,在基于miRNA构建的癌症网络中,前列腺癌与乳腺癌,结肠癌与乳腺癌之间共享较多的miRNAs,表明了这些癌症在miRNA层面上存在密切的关系。

关 键 词:microRNA  癌症  富集分析
收稿时间:2008-11-06

Common Mechanism of Cancer at MicroRNA Level
Affiliation:1. Capital Medical University, Department of Biomedical Engineering, Beijing 100069, China;
2. Harbin Medical University, Department of Bioinformatics, Harbin 150081, China
Abstract:
Keywords:microRNA  Cancer  Enrichment analysis
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