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秦川牛GH基因第5外显子的多态性及其与体尺性状的关联性
引用本文:胡怡菲,昝林森,王洪宝.秦川牛GH基因第5外显子的多态性及其与体尺性状的关联性[J].西北农林科技大学学报(社会科学版),2010,38(6):47-55.
作者姓名:胡怡菲  昝林森  王洪宝
作者单位:西北农林科技大学 动物科技学院;西北农林科技大学 动物科技学院;国家肉牛改良中心;西北农林科技大学 动物科技学院;国家肉牛改良中心
基金项目:国家“863”高新技术研究与发展计划项目(2006AA10Z1A1);国家“十一五”科技支撑计划项目(2006BAD01A10-3);陕西省13115科技创新专项(2007ZDG/-01)
摘    要:【目的】研究秦川牛生长激素基因第2外显子的多态性,及其与部分体尺性状指标的相关性。【方法】以502头2周岁左右秦川牛为研究对象,利用PCR-RFLP技术检测生长激素基因上存在的单核苷酸多态性(SNPs),并分析其与秦川牛体尺性状的关联性。【结果】在GH基因第5外显子中发现了2处SNPs,分别为错义突变和同义突变。位点1经AluⅠ酶切后产生AA、AB和BB 3种基因型,A、B等位基因频率分别为0.825 7和0.174 3;卡方检测显示,该位点在所检测秦川牛群体中处于Hardy-Weinbery不平衡状态;关联分析表明,该位点不同基因型个体之间在体高、胸围、体斜长和尻长上差异显著。位点2经AflⅡ酶切后产生CC和CD 2种基因型,C和D等位基因的频率分别为0.902 4和0.097 6;卡方检测显示,该位点在所检测秦川牛群体中处于Hardy-Weinbery不平衡状态;关联分析表明,该位点不同基因型个体间在腰角宽、坐骨端宽和尻长上差异显著。第5外显子2个位点合并基因型分析结果表明,双杂合基因型个体各体尺性状均显著高于其他基因型组合,并且多标记位点的组合效应高于单标记位点。【结论】组合ABCD各体尺性状数值均高于AB和CD基因型,组合ABCD可能是影响牛体尺性状的最佳基因型组合。

关 键 词:秦川牛  生长激素基因  PCR-RFLP  合并基因型
收稿时间:2009/12/17 0:00:00

Association between polymorphism of exon 5 in GH gene and partial body measurement traits in Qinchuan cattle
HU Yi-fei,ZAN Lin-sen,WANG Hong-bao,HUANG Lei,ZHONG Xin,LI Chang-qing.Association between polymorphism of exon 5 in GH gene and partial body measurement traits in Qinchuan cattle[J].Journal of Northwest Sci-Tech Univ of Agr and,2010,38(6):47-55.
Authors:HU Yi-fei  ZAN Lin-sen  WANG Hong-bao  HUANG Lei  ZHONG Xin  LI Chang-qing
Affiliation:1(1 College of Animal Science and Technology,Nothwest A&F University,Yangling,Shaanxi 712100,China;2 National Beef Cattle Improvement Center,Yangling,Shaanxi 712100,China)
Abstract:
Keywords:Qinchuan cattle  growth hormone gene  PCR-RFLP  combined genotype
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