宏基因组二代测序在重症肺炎患者病原学中的应用 |
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引用本文: | 何德华,刘明,陈启敏,刘旭.宏基因组二代测序在重症肺炎患者病原学中的应用[J].实用医学杂志,2023(8):948-952. |
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作者姓名: | 何德华 刘明 陈启敏 刘旭 |
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作者单位: | 贵州医科大学附属医院重症医学科 |
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基金项目: | 国家重点研发计划(编号:2018YFC2001904);;国家自然科学基金项目(编号:81960357,81701958);;贵州省科技计划项目(编号:黔科合基础[2020]1Y330,黔科合基础-ZK[2022]一般370); |
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摘 要: | 目的 探究重症肺炎患者肺泡灌洗液(BALF)宏基因组二代测序(mNGS)与传统培养病原学诊断的差异以及mNGS结果对抗生素方案调整的影响。方法 回顾性分析2019年8月至2021年4月于贵州医科大学附属医院重症医学科住院期间,同时送检BALF传统培养和mNGS的重症肺炎患者。比较两种病原学检测结果的差异,分析mNGS与传统培养诊断的阳性率、一致性及抗生素方案的调整。结果研究期间共纳入患者75例,其中mNGS的阳性率为97.3%,传统培养阳性率为41.3%;mNGS细菌的检出率为94.7%,传统培养细菌检出率为38.7%;mNGS真菌检出次数最多的为耶氏肺孢子菌24.0%。mNGS对于罕见菌、不典型菌、真菌以及病毒的阳性率远高于传统培养。两组病原学检测结果一致性差(Kappa=0.038,P=0.229),mNGS较传统培养检出更多种类的微生物。基于mNGS检测结果,临床医生对于69%的患者进行抗生素方案的调整。结论 mNGS在重症肺炎患者病原学诊断中敏感性高,对于免疫抑制重症肺炎患者尤为适用。同时,mNGS可以指导临床医师调整抗生素策略。
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关 键 词: | 宏基因组二代测序 重症肺炎 病原学 抗生素策略 |
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