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沙田柚F-box蛋白基因的克隆及序列分析
引用本文:郭丹妮,刘玉洁,张渝,顾金燕,覃信梅,李惠敏,秦新民.沙田柚F-box蛋白基因的克隆及序列分析[J].湖北农业科学,2016(14).
作者姓名:郭丹妮  刘玉洁  张渝  顾金燕  覃信梅  李惠敏  秦新民
作者单位:广西师范大学生命科学学院/珍稀濒危动植物生态与环境保护省部共建教育部重点实验室,广西桂林,541004
基金项目:国家自然科学基金项目(31360477),广西教育厅项目(2013YB036)
摘    要:采用生物信息学方法,对沙田柚Citrus maxima(Burm.)Merr.cv.Shatian Yu.]F-box蛋白基因编码的蛋白质从序列特征、理化性质、跨膜结构域、高级结构及功能域等方面进行了预测和分析。结果表明,该基因全长为1 427 bp(Gen Bank登录号为KR363148),开放阅读框(ORF)全长为1 101 bp,共编码366个氨基酸,编码蛋白质的分子质量43.09 ku,理论等电点5.15。沙田柚F-box蛋白基因编码蛋白含有一个植物F-box蛋白家族的保守结构域,为亲水性非分泌不稳定蛋白,不跨膜运动,共有30个可能的磷酸化位点。氨基酸序列分析表明,其编码的氨基酸与甜橙(Citrus sinensis,KDO71185)和克莱门柚(Citrus clementina,XP_006425495)F-box蛋白的同源性分别为99%、98%。系统进化树表明,沙田柚F-box蛋白基因与与甜橙(Citrus sinensis,KDO71185)和克莱门柚(Citrus clementina,XP_006425495)亲缘关系很近,属于同一进化分支。

关 键 词:沙田柚[Citrus  maxima(Burm.)Merr.cv.Shatian  Yu.]  F-box蛋白基因  序列分析

Cloning and Sequence Analysis of F-box Protein Gene of Citrus maxima (Burm.) Merr.cv.Shatian Yu.
Abstract:
Keywords:Citrus maxima (Burm  ) Merr  cv  Shatian Yu    F-box protein gene  sequence analysis
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