| 日本落叶松咖啡酸-O-甲基转移酶基因 LkCOMT的克隆及单核苷酸多态性分析 |
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| 引用本文： | 易敏,张守攻,谢允慧,孙晓梅.日本落叶松咖啡酸-O-甲基转移酶基因 LkCOMT的克隆及单核苷酸多态性分析[J].林业科学研究,2013,26(S1):52-59. |
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| 作者姓名： | 易敏 张守攻 谢允慧 孙晓梅 |
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| 作者单位： | 林木遗传育种国家重点实验室, 中国林业科学研究院林业研究所, 北京 100091;林木遗传育种国家重点实验室, 中国林业科学研究院林业研究所, 北京 100091;林木遗传育种国家重点实验室, 中国林业科学研究院林业研究所, 北京 100091;林木遗传育种国家重点实验室, 中国林业科学研究院林业研究所, 北京 100091 |
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| 基金项目： | 国家"973"计划项目(2009CB119100);国家863项目(2011AA100203) |
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| 摘 要： | 依据日本落叶松转录组数据库检测到的咖啡酸-O-甲基转移酶(COMT)基因ESTs序列设计引物,分离得到一个编码该酶的新基因。其cDNA克隆全长为1 350 bp,包含长度为1 092 bp的开放阅读框,可编码364个氨基酸残基。序列分析显示,所推导的蛋白质氨基酸序列包含COMT基因5个所特有的保守元件,与海岸松PpCOMT的蛋白质氨基酸序列同源性达94%。在此基础上,利用DnaSP5.0软件对日本落叶松40株基因型个体的LkCOMT序列进行了单核苷酸多样性SNPs分析,共检测到92个SNP位点,SNP发生频率为1/17 bp,多样性指数πT为0.007 80。在这些SNPs中,65个属于转换,27个属于颠换。在外显子区域,共检测到58个SNP位点,其中37个为错义突变,21个为同义突变。研究结果为日本落叶松基因标记辅助育种提供了理论基础。
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| 关 键 词： | 日本落叶松 咖啡酸-O-甲基转移酶基因 基因克隆 单核苷酸多态性 |
| 收稿时间： | 2013/8/20 0:00:00 |
Isolation and Single Nucleotide Polymorphisms Analysis of Caffeic Acid O-methyltransferase (LkCOMT) in Larix kaempferi |
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| YI Min,ZHANG Shou-gong,XIE Yun-hui and SUN Xiao-mei.Isolation and Single Nucleotide Polymorphisms Analysis of Caffeic Acid O-methyltransferase (LkCOMT) in Larix kaempferi[J].Forest Research,2013,26(S1):52-59. |
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| Authors: | YI Min ZHANG Shou-gong XIE Yun-hui and SUN Xiao-mei |
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| Affiliation: | State Key Laboratory of Tree Genetics and Breeding, Research Institute of Forestry, Chinese Academy of Forestry, Beijing 100091, China;State Key Laboratory of Tree Genetics and Breeding, Research Institute of Forestry, Chinese Academy of Forestry, Beijing 100091, China;State Key Laboratory of Tree Genetics and Breeding, Research Institute of Forestry, Chinese Academy of Forestry, Beijing 100091, China;State Key Laboratory of Tree Genetics and Breeding, Research Institute of Forestry, Chinese Academy of Forestry, Beijing 100091, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Larix kaempferi caffeic acid O-methyltransferase gene cloning single nucleotide polymorphism |
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