| 奶牛plgR基因5'侧翼区SNP检测及其与IgA和IgM含量的相关性研究 |
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| 引用本文： | 张春刚,王加启,卜登攀,刘光磊,程金波,董晓丽,赵国琦,魏宏阳,周凌云,刘开朗.奶牛plgR基因5''侧翼区SNP检测及其与IgA和IgM含量的相关性研究[J].中国农业大学学报,2008,13(4). |
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| 作者姓名： | 张春刚 王加启 卜登攀 刘光磊 程金波 董晓丽 赵国琦 魏宏阳 周凌云 刘开朗 |
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| 基金项目： | 国家科技支撑计划
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国家自然科学基金
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中国农业科学院北京畜牧兽医研究所青年基金 |
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| 摘 要： | 本试验研究了pIgR基因5'侧翼区的多态性及其对IgA和IgM含量的影响.从NCBI上的MaP Viewer数据库下载牛pIgR基因的5'侧翼区的序列(NW_174143),长度为3.2 kb,设计4对引物进行PCR扩增,通过对25头奶牛的PCR产物直接测序发现并确定SNP位点,并用SNP Stream标签微列阵基因分型系统对189头牛进行基因分型,将其与牛奶和血液中的IgA和IgM的含量进行关联分析.结果表明,pIgR基因在-3128、-3072、-2834、-2348和-515位发现了5个SNP位点,其中SNPI和SNP2为A/G突变,SNP3、SNP4和SNP5为T/C突变.方差分析结果表明,SNPI对牛奶IgM和血液IgA含量有显着的影响(P<0.05),SNP3和SNP5对血液IgM含量有显着影响(P<0.05),其他SNP位点与单倍型组合对乳及血液中IgA和IgM的含量均没有显著影响(P<0.05);多重比较分析表明,SNPl位点的基因型AB个体与BB个体的牛奶IgM和血液IgA含量的最小二乘均数差异显著(P<0.05),SNP3和SNP5的不同基因型对血液IgM含量的最小二秉均数分别达到了显著水平(P<0.05).因此得出,牛pIgR基因5'侧翼区的多态性影响牛奶和血液中的IgA和IgM的含量,这为进一步研究牛奶中IgA和IgM分泌转运机理提供了理论依据.
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| 关 键 词： | pIgR基因 IgA和IgM SNP 单倍型 奶牛 不同基因型 检测 含量 相关性研究 detection concentration association gene region 理论 机理 水平 差异显著 均数 最小 分析表 多重比较 组合 单倍型 |
SNP detection in 5' flanking region of plgR gene and association with IgA and IgM concentration in dairy cowsZHANG Chun-gang, WANG Jia-qi, BU Deng-pan, LIU Guang-lei, CHENG din-bo |
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| ZHANG Chun-gang,WANG Jia-qi,BU Deng-pan,LIU Guang-lei,CHENG Jin-bo,DONG Xiao-li,ZHAO Guo-qi,WEI Hong-yang,ZHOU Ling-yun,LIU Kai-lang.SNP detection in 5'' flanking region of plgR gene and association with IgA and IgM concentration in dairy cowsZHANG Chun-gang, WANG Jia-qi, BU Deng-pan, LIU Guang-lei, CHENG din-bo[J].Journal of China Agricultural University,2008,13(4). |
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| Authors: | ZHANG Chun-gang WANG Jia-qi BU Deng-pan LIU Guang-lei CHENG Jin-bo DONG Xiao-li ZHAO Guo-qi WEI Hong-yang ZHOU Ling-yun LIU Kai-lang |
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