| 序列比较分析揭示水稻Pms1区段基因组的快速进化 |
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| 引用本文： | 於金生,范优荣,刘南,山燕,李香花,张启发.序列比较分析揭示水稻Pms1区段基因组的快速进化[J].科学通报,2007,52(5). |
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| 作者姓名： | 於金生 范优荣 刘南 山燕 李香花 张启发 |
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| 作者单位： | 作物遗传改良国家重点实验室,国家植物基因研究中心(武汉),武汉,430070 |
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| 基金项目： | 国家高技术研究发展计划(863计划)，国家自然科学基金 |
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| 摘 要： | 以前的研究将水稻光敏核不育位点Pms1定位在第7染色体上.本研究对来源于定位亲本(明恢63和农垦58)的两个BAC克隆进行比较测序,以鉴定Pms1的候选基因;并通过对两个克隆的注释和比较得到5个候选基因,以进行进一步的功能检验.将这两个亲本的基因组序列与公共数据库里的日本晴和93-11比较分析,结果显示,该区段4个亲本在序列组成上存在巨大差异,这种差异主要归咎于活性反转座成分造成的基因组新近增长和变异;亚种内和亚种间以Indel或者SNP的形式存在高度的多态性.利用反转座成分的两个长末端重复进行分析发现,它们的替换速率比已有的报道要高得多.该结果证明,在自然和人工选择的共同作用下,Pms1区段正处于快速的基因组进化过程中.
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| 关 键 词： | 光敏感雄性核不育 基因组结构 反转录转座子 插入年代估计 选择 |
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