| 拟南芥基因芯片数据中非生物胁迫相关基因的挖掘 |
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| 引用本文： | 束永俊,李勇,柏锡,才华,纪巍,朱延明.拟南芥基因芯片数据中非生物胁迫相关基因的挖掘[J].生物信息学,2009,7(3):168-170,177. |
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| 作者姓名： | 束永俊 李勇 柏锡 才华 纪巍 朱延明 |
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| 作者单位： | 东北农业大学生命科学学院,哈尔滨,150030 |
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| 基金项目： | 国家自然基金项目资助，国家高技术研究发展计划(863计划)资助 |
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| 摘 要： | 利用方差分析法从拟南芥芯片表达谱数据库挖掘非生物胁迫相关基因，并对这些基因进行GO注释分析，从而揭示非生物胁迫的生物学意义，发现非生物胁迫主要影响植物基因表达过程的转录调节和信号转导过程的磷酸化。同时对这些基因的上游启动子区域序列进行分析，挖掘非生物胁迫反应调控过程和适应过程的转录因子，发现植物非生物胁迫过程主要受bHLH—ZIP类和ZN—FINGER类C2H2型转录因子的调节。
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| 关 键 词： | 非生物胁迫 基因芯片 基因挖掘 转录因子 |
Mining abiotic response genes from Arabidopsis microarray expression data |
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| SHU Yong-jun,LI Yong,BAI Xi,CAI Hua,JI Wei,ZHU Yan-ming.Mining abiotic response genes from Arabidopsis microarray expression data[J].China Journal of Bioinformation,2009,7(3):168-170,177. |
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| Authors: | SHU Yong-jun LI Yong BAI Xi CAI Hua JI Wei ZHU Yan-ming |
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| Affiliation: | ( College of Life Science, Northeast Agricultural University, Harbin 150030, P. R. China ) |
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| Abstract: | |
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