食用黄花菜SSR标记开发及指纹图谱库构建

利用转录组测序技术开发SSR标记，旨在为食用黄花菜种质资源鉴定、评价及遗传多样性分析提供技术支撑。测序共得到104 177个Unigene,总长度为79 106 833 bp,平均长度为759 bp,利用MISA软件对Unigene进行搜索，共检测到15 890个SSR,其中单核苷酸、二核苷酸和三核苷酸重复占比较高，分别为18.57%、27.23%和44.26%。设计合成SSR引物114对，通过聚丙烯酰氨凝胶电泳最终筛选出20对核心引物，20对引物在43份黄花菜种质中共检测到88个等位变异，每个位点的等位变异数为3～8个，平均为4.4个，多态信息含量(polymorphism information content, PIC)值变幅为0.23～0.77,平均为0.499 5。依据扩增产物的片段大小确定了每个SSR位点的等位变异以及对应的参照品种，建立了基于SSR的DNA指纹鉴定技术体系，并构建了43份黄花菜种质的DNA指纹数据。该研究开发的SSR标记具有丰富的多态性。