| 缢蛏糖原磷酸化酶基因多态性与糖原含量的关联分析 |
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| 引用本文： | 陈燕园,林志华,刘圣,姚韩韩,董迎辉.缢蛏糖原磷酸化酶基因多态性与糖原含量的关联分析[J].海洋学报,2022,44(2):77-83. |
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| 作者姓名： | 陈燕园 林志华 刘圣 姚韩韩 董迎辉 |
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| 作者单位： | 浙江万里学院生物与环境学院浙江省水产种质资源高效利用技术研究重点实验室,浙江宁波 315100;上海海洋大学水产科学国家级实验教学示范中心,上海 201306;浙江万里学院生物与环境学院浙江省水产种质资源高效利用技术研究重点实验室,浙江宁波 315100;浙江万里学院宁海海洋生物种业研究院,浙江宁海 315604;浙江万里学院宁海海洋生物种业研究院,浙江宁海 315604;浙江万里学院生物与环境学院浙江省水产种质资源高效利用技术研究重点实验室,浙江宁波 315100 |
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| 摘 要： | 为探究缢蛏糖原磷酸化酶基因(Sc-GPH)与糖原含量的关系,本研究克隆获得Sc-GPH cDNA全长,检测其在不同组织、不同月份的表达模式,并在Sc-GPH基因编码区筛选与糖原含量关联的SNP位点.结果表明,Sc-GPH cDNA全长为3963 bp,开放阅读框为2541 bp,编码846个氨基酸;氨基酸序列多重比对和系统发育树显示,缢蛏与欧洲大扇贝、虾夷扇贝、长牡蛎等贝类亲缘关系较近,而与哺乳类、甲壳类、昆虫类亲缘关系较远.实时荧光定量PCR结果显示,Sc-GPH在8个组织中均有表达,其中在外套膜和足中表达量最高(p<0.01),推测与其糖原存储能力有关;不同月份的缢蛏外套膜和足中,Sc-GPH在8月表达量最高,而此时糖原含量较低,说明Sc-GPH的表达可能受缢蛏生殖周期的影响.以缢蛏"甬乐1号"群体为实验材料,在Sc-GPH基因编码区筛选到4个与糖原含量相关SNP位点,其中c.930T>C位点在台州野生群体中得到进一步验证,该位点为高糖原缢蛏分子标记辅助选育提供了候选标记.
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| 关 键 词： | 缢蛏 糖原磷酸化酶 糖原含量 SNP 关联分析 |
The association of single nucleotide polymorphisms of the glycogen phosphorylase gene with glycogen content in the razor clam Sinonovacula constricta |
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| Chen Yanyuan,Lin Zhihua,Liu Sheng,Yao Hanhan,Dong Yinghui.The association of single nucleotide polymorphisms of the glycogen phosphorylase gene with glycogen content in the razor clam Sinonovacula constricta[J].Acta Oceanologica Sinica (in Chinese),2022,44(2):77-83. |
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| Authors: | Chen Yanyuan Lin Zhihua Liu Sheng Yao Hanhan Dong Yinghui |
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