丹参转录因子SmbHLH93的克隆及表达模式分析 |
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引用本文: | 周宏骏,武玉翠,晋鑫鑫,饶丽华,王喆之.丹参转录因子SmbHLH93的克隆及表达模式分析[J].中草药,2014,45(23):3449-3455. |
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作者姓名: | 周宏骏 武玉翠 晋鑫鑫 饶丽华 王喆之 |
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作者单位: | 陕西师范大学生命科学学院, 教育部药用资源与天然药物化学重点实验室, 西北濒危药材资源开发国家工程实验室, 陕西 西安 710062;陕西师范大学生命科学学院, 教育部药用资源与天然药物化学重点实验室, 西北濒危药材资源开发国家工程实验室, 陕西 西安 710062;陕西师范大学生命科学学院, 教育部药用资源与天然药物化学重点实验室, 西北濒危药材资源开发国家工程实验室, 陕西 西安 710062;陕西师范大学生命科学学院, 教育部药用资源与天然药物化学重点实验室, 西北濒危药材资源开发国家工程实验室, 陕西 西安 710062;陕西师范大学生命科学学院, 教育部药用资源与天然药物化学重点实验室, 西北濒危药材资源开发国家工程实验室, 陕西 西安 710062 |
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基金项目: | 国家自然科学基金资助项目(31270338);陕西省科技厅科技计划项目(2012K19-02-04);陕西学前师范学院基金(2014QNKJ078,2014QNKJ079) |
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摘 要: | 目的 克隆丹参碱性螺旋-环-螺旋(bHLH)类转录因子SmbHLH93,并初步探究该基因的功能.方法 采用PCR和RT-PCR技术分别从DNA和cDNA水平克隆得到了SmbHLH93基因,进一步通过BD Walking获得了该基因的5'启动子区.生物信息学分析SmbHLH93蛋白的理化性质、结构特点和系统进化关系.结合启动子区分析软件和qPCR,研究SmbHLH93在丹参不同部位和环境诱导下的表达模式.结果 获得SmbHLH93基因序列954 bp和5'启动子区1 583 bp,其中开放阅读框(ORF)657 bp,有3个内含子和4个外显子,编码218个氨基酸,含有bHLH和ACT_UUR-ACR-like结构域,无跨膜区域,可能定位于细胞核.表达模式分析结果显示该基因的表达量在根中最高,茎中最低,且随着花的形成逐渐降低.光和低温诱导SmbHLH93的高表达,而水杨酸(SA)抑制其表达.结论 克隆得到丹参bHLH类转录因子新成员SmbHLH93,初步预测其参与了丹参花的发育过程和丹参次生代谢途径的调控.
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关 键 词: | 丹参 SmbHLH93 基因克隆 生物信息学 表达模式分析 |
收稿时间: | 2014/4/12 0:00:00 |
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