基于mRNA高通量测序筛选调控小鼠术后谵妄重要差异基因 |
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引用本文: | 饶耘菊,陈思雨,杨海红,巩固,.基于mRNA高通量测序筛选调控小鼠术后谵妄重要差异基因[J].四川医学,2022,43(12):1191-1196. |
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作者姓名: | 饶耘菊 陈思雨 杨海红 巩固 |
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作者单位: | 西南医科大学临床医学院;西部战区总医院麻醉科 |
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摘 要: | 目的 基于高通量测序技术筛选小鼠海马组织中术后谵妄(POD)发生的相关重要差异基因。方法 将16只健康雌性C57小鼠随机分为术后谵妄(POD组)和对照组(CON组),每组8只。采用异氟烷麻醉下剖腹探查构建POD模型,术后多时间点行为学检测POD改变。于造模后24 h收集小鼠海马组织进行高通量测序,对显著差异基因进行基因本体(GO)分析及京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路数据库分析,采用RT-qPCR验证关键差异表达基因(DEGs)。结果 相比于对照组,POD组共鉴定了105个DEGs,其中79个DEGs上调,26个DEGs下调;GO分析结果显示,主要富集的生物过程包括应激反应、代谢过程等,主要表达于细胞器、细胞膜,参与的分子过程涉及转录活性调节等。KEGG分析提示,通路主要富集于NF-κB、趋化因子、mTOR、FoxO和Hippo等信号通路;综合上述结果并结合RT-qPCR验证筛选出Cdkn1a、Nfkbia、Card14、Wnt3、Bcl2、Gng11、Grm3和Akt2 8个关键基因。结论 高通量测序筛选出的差异表达基因,可能通过NF-κB、趋化因子、mTOR等信号通路介导POD发生。
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关 键 词: | 术后谵妄 高通量测序 关键差异基因 |
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