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基于荧光显微镜图像的神经丝自动跟踪
引用本文:袁亮,朱俊达.基于荧光显微镜图像的神经丝自动跟踪[J].计算机应用与软件,2015(6).
作者姓名:袁亮  朱俊达
作者单位:1. 新疆大学机械工程学院 新疆 乌鲁木齐 830047
2. 澳门大学电子与计算机工程系 澳门 000853
基金项目:国家自然科学基金项目(31460248,61262059)。新疆优秀青年科技创新人才培养项目(2013721016);新疆自治区科技支疆项目(201591102)。
摘    要:神经丝是一种长而柔软的蛋白质有机物,它能在神经细胞中沿着神经轴突快速且随机地运动。神经丝的运动研究对于如神经退行性疾病的诊断等应用是非常重要的。传统的方法在很大程度上依赖于在荧光显微镜图像下手工标记神经丝。这种人工跟踪不但对大量图像实现起来非常费时,而且会带来很多人为跟踪误差。提出神经丝全自动跟踪的方法:粒子滤波跟踪算法和检测跟踪算法。在这两种算法中,都利用了神经丝在神经轴突内运动这一特征。在粒子滤波算法中,限制了粒子的位置和方向,从而显著地降低了粒子使用的数量,大大减少了算法的运算时间。在检测跟踪算法中,提取出沿轴突运动的神经丝轨迹并描绘成一条参数化曲线,利用马尔可夫随机场图形标签来确定包含运动神经丝的轴突块,将神经丝的首端和尾端位置细化到亚像素精度。在实际的实时跟踪实验中,将粒子滤波跟踪算法与检测跟踪算法进行比较,显示出了检测跟踪算法在运算速度和跟踪准确性方面优于粒子滤波算法。

关 键 词:荧光显微镜  神经丝  轴突约束  粒子滤波  马尔科夫随机场

AUTOMATED NEUROFILAMENTS TRACKING BASED ON FLUORESCENCE MICROSCOPY IMAGES
Yuan Liang,Zhu Junda.AUTOMATED NEUROFILAMENTS TRACKING BASED ON FLUORESCENCE MICROSCOPY IMAGES[J].Computer Applications and Software,2015(6).
Authors:Yuan Liang  Zhu Junda
Abstract:
Keywords:Fluorescence microscopy  Neurofilament  Axonal constraint  Particle filtering  Markov random field
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