| 茄子全基因组InDel变异特征及分子标记开发和应用 |
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| 引用本文： | 尤园园,王帅,方莹莹,齐诚,李淑培,张映,陈钰辉,刘伟,刘富中,舒金帅.茄子全基因组InDel变异特征及分子标记开发和应用[J].园艺学报,2024(3):520-532. |
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| 作者姓名： | 尤园园 王帅 方莹莹 齐诚 李淑培 张映 陈钰辉 刘伟 刘富中 舒金帅 |
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| 作者单位： | 1. 中国农业科学院蔬菜花卉研究所,蔬菜生物育种全国重点实验室;2. 河北科技师范学院园艺科技学院;3. 中国农业科学院寿光蔬菜研发中心 |
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| 基金项目： | 中央级公益性科研院所基本科研业务费专项（IVF-BRF2022003,IVF-BRF2021006）； |
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| 摘 要： | 选取4份圆茄(Solanum melongena L.)高代自交系进行全基因组重测序,鉴定出145 407个InDel,12号染色体InDel数最少(7 752),1号最多(19 738)。筛选出7 959个长度大于10bp的InDel位点,挑选均匀分布在基因组上的144个设计InDel引物并进行验证。利用26份茄子材料对144对InDel引物进行筛选,63对表现出稳定的多态性,比例为43.75%;主要等位基因频率为0.4038～0.9808,平均为0.7659;基因多样性指数(Hs)为0.0377～0.6501,平均为0.3217;多态性信息含量(PIC)为0.0370～0.5750,平均为0.2663,42个标记多态性信息含量大于0.200,多态性较好。当遗传距离为0.235时,将26份不同类型的茄子材料划分为2个类群。利用多态性信息含量高的前10个InDel标记构建了26份茄子材料DNA指纹图谱。另外,选择在亲本间具有多态性的InDel标记用于4个杂交组合的F1代真实性鉴定,鉴定结果表明3个为真实杂交种,与田间鉴定结果吻合。
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| 关 键 词： | 茄子 InDel标记 遗传多样性 指纹图谱 F1代真实性鉴定 |
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