| PCR-DGGE技术用于湖泊沉积物中微生物群落结构多样性研究 |
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| 引用本文： | 赵兴青,杨柳燕,陈灿,肖琳,蒋丽娟,马喆,朱昊巍,于振洋,尹大强.PCR-DGGE技术用于湖泊沉积物中微生物群落结构多样性研究[J].生态学报,2006,26(11):3610-3616. |
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| 作者姓名： | 赵兴青 杨柳燕 陈灿 肖琳 蒋丽娟 马喆 朱昊巍 于振洋 尹大强 |
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| 作者单位： | 污染控制与资源化研究国家重点实验室,南京大学环境学院,南京,210093 |
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| 基金项目： | 国家重点基础研究发展计划(973计划);国家重大水环境专项项目;国家自然科学基金 |
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| 摘 要： | 采用PCR-DGGE分子指纹图谱技术比较南京市玄武湖、奠愁湖和太湖不同位置的表层沉积物微生物群落结构，研究结果表明，三湖泊沉积物微生物的16SrDNA的PCR扩增结果约为626bp，为16S rDNA V3～V5区特异性片段。玄武湖和莫愁湖表层沉积物中大约有20种优势菌群，且同一湖泊不同采样点DGGE图谱的差异性不大，细菌群落结构具有较高的相似性，而太湖样品DGGE条带的数目和位置表现出明显差异，且不同采样点图谱的差异性较大。三湖泊除具有特征性的微生物种属外，还分布约5个相同的细菌种群，可能与沉积物的理化性质和水生植被的影响相关。对DGGE图谱中7条主带进行回收、扩增和测序，结果显示其优势菌群具有不同的序列组成，其中5个序列与Genebank中已登录的细菌种群的同源性≥99％，2个序列的同源性为96％和93％，其中2个相似的细菌类群目前尚未获得纯培养。
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| 关 键 词： | 沉积物 微生物多样性 变性梯度凝胶电泳(DGGE) 序列测定 |
| 文章编号： | 1000-0933（2006）11-3610-07 |
| 收稿时间： | 2006-04-12 |
| 修稿时间： | 2006-04-122006-07-12 |
Study on the microbial diversity in lake sediments by the method of PCR-DGGE |
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| ZHAO Xingqing,YANG Liuyan,CHEN Can,XIAO Lin,JIANG Lijuan,MA Zhe,ZHU Haowei,YU Zhenyang and YIN Daqiang.Study on the microbial diversity in lake sediments by the method of PCR-DGGE[J].Acta Ecologica Sinica,2006,26(11):3610-3616. |
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| Authors: | ZHAO Xingqing YANG Liuyan CHEN Can XIAO Lin JIANG Lijuan MA Zhe ZHU Haowei YU Zhenyang and YIN Daqiang |
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| Affiliation: | State Key Laboratory of Pollution Control and Resource Reuse. School of the Environment, Nanjing University, Nanjing 210093, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | 16S rDNA |
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