| hsa-miR-126的靶基因预测及其生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 陈妍珂,张 徐,吴近珠,王婷婷,崔玉宝.hsa-miR-126的靶基因预测及其生物信息学分析[J].现代生物医学进展,2018(23):4564-4570. |
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| 作者姓名： | 陈妍珂 张 徐 吴近珠 王婷婷 崔玉宝 |
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| 作者单位： | 江苏大学医学院 江苏 镇江 212000;南京医科大学附属无锡人民医院 江苏 无锡 214000 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目（NSFC31572319） |
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| 摘 要： | 目的:采用生物信息学的方法预测hsa-miR-126的靶基因及相关功能,为后续研究提供理论基础。方法:采用PubMed搜索hsa-miR-126相关文章,总结目前研究进展,使用mi RBase获得hsa-miR-126的基本信息,并用NCBI BLAST分析其序列保守性,以Targetscan、mi Randa及PicTar预测结果的两两交集为预测靶基因,并结合mi RTarBase上已证实的靶基因作为基因集合做GO分析和Pathway分析。结果:搜索PubMed获得相关文献24篇,多数研究集中于hsa-miR-126与肿瘤的关系,hsa-miR-126在多种物种间具有高度保守性,其5个预测靶基因和46个已证实靶基因于白细胞迁移、对糖皮质激素反应、促进内皮细胞增殖、蛋白信号转导等有功能富集(P0.01),于多种肿瘤如肾细胞癌、前列腺癌、非小细胞肺癌、胰腺癌有信号通路富集(P0.01)。结论:hsa-miR-126可能参与多种肿瘤的发生发展过程。
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| 关 键 词： | hsa-miR-126 microRNA 靶基因 生物信息学 肿瘤 |
| 收稿时间： | 2018/4/7 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2018/4/30 0:00:00 |
Prediction of Target Genes and Bioinformatics Analysis of Hsa-miR-126 |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Hsa-miR-126 MicroRNA Target gene Bioinformatics Tumor |
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