| 蟾蜍TNFRSF11b、TNFRSF9基因克隆及生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 苏岩,褚涵,余坤,潘瑞,叶陈娟,李军德,黄晓,张恬.蟾蜍TNFRSF11b、TNFRSF9基因克隆及生物信息学分析[J].中国现代中药,2023,25(8):1655-1667. |
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| 作者姓名： | 苏岩 褚涵 余坤 潘瑞 叶陈娟 李军德 黄晓 张恬 |
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| 作者单位： | 1.重庆市中药研究院 重庆市中药资源学重点实验室，重庆 400065;2.湖北中医药大学 药学院，湖北 武汉 430065;3.中国中医科学院 中药资源中心 重庆分中心，重庆 400065;4.中国中医科学院 中药资源中心，北京 100700;5.中药资源与中药化学湖北省重点实验室，湖北 武汉 430060 |
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| 基金项目： | 重庆市科技局绩效激励引导专项（cqac20190001）；湖北中医药大学2020年青苗计划资助项目（2020ZZX002） |
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| 摘 要： | 目的 克隆中华蟾蜍肿瘤坏死因子受体超家族（TNFRSF）BbgTNFRSF11b、BbgTNFRSF9基因的全长序列，并分析其序列特征。方法 根据转录组测序所得的TNFRSF11b、TNFRSF9基因片段设计特异性引物，以中华蟾蜍蟾皮为材料，利用逆转录聚合酶链式反应（PCR）技术获得BbgTNFRSF11b、BbgTNFRSF9基因全长互补脱氧核糖核酸（cDNA）序列，并采用生物信息学手段分析其序列特征，通过实时荧光定量PCR方法检测BbgTNFRSF11b、BbgTNFRSF9基因在中华蟾蜍7种组织/器官中的表达情况。结果 克隆获得蟾蜍BbgTNFRSF11b基因的全长cDNA序列为1233 bp，编码410个氨基酸，理论相对分子质量为46.97 kDa，等电点为8.64，不存在跨膜区及信号肽，为亲水性蛋白，具有多个磷酸化位点。BbgTNFRSF9基因的全长cDNA序列为829 bp，编码247个氨基酸，理论相对分子质量为67.874 kDa，理论等电点为5.12，存在信号肽，为疏水性蛋白，具有多个磷酸化位点，进化树分析发现BbgTNFRSF11b、BbgTNFRSF9基因与其他动物TNFRSF11b、TNFRSF9基因相似度不高，表明该基因虽有特殊结构域但不同物种间差异较大。组织表达分析显示，BbgTNFRSF11b、BbgTNFRSF9基因在耳后腺中表达显著高于其他部位。结论 成功获得蟾蜍BbgTNFRSF11b、BbgTNFRSF9基因序列，掌握其序列特征，为后续深入研究该蛋白的功能提供参考。
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| 关 键 词： | 蟾蜍 基因克隆 序列分析 肿瘤坏死因子受体超家族 |
| 收稿时间： | 2022/11/17 0:00:00 |
Cloning and Bioinformatics Analysis of TNFRSF11b and TNFRSF9 in Bufo gargarizans Cantor |
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| SUN Yan,CHU Han,YU Kun,PAN Rui,YE Chen-juan,LI Jun-de,HUANG Xiao,ZHANG Tian.Cloning and Bioinformatics Analysis of TNFRSF11b and TNFRSF9 in Bufo gargarizans Cantor[J].Modern Chinese Medicine,2023,25(8):1655-1667. |
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| Authors: | SUN Yan CHU Han YU Kun PAN Rui YE Chen-juan LI Jun-de HUANG Xiao ZHANG Tian |
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| Affiliation: | 1.Chongqing Key Laboratory of Traditional Chinese Medicine Resource, Chongqing Academy of Chinese Materia Medica, Chongqing 400065, China;2.College of Pharmacy, Hubei University of Chinese Medicine, Wuhan 430065, China;3.Chongqing Branch of National Resource Center for Chinese Materia Medica, China Academy of;Chinese Medical Sciences, Chongqing 400065, China;4.State Key Laboratory of Dao-di Herbs, National Resource Center for Chinese Materia Medica, China Academy of Chinese Medical Sciences, Beijing 100700, China;5.Hubei Key Laboratory of Traditional Chinese Medicine Resource and Chemistry, Hubei University of Chinese Medicine, Wuhan 430060, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Bufo gargarizans Cantor gene cloning sequence analysis tumor necrosis factor receptor superfamily (TNFRSF) |
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