健康和患病克氏原螯虾肠道微生物群落结构和多样性分析 |
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引用本文: | 张立强,李媛,邓平,魏朝辉,丁桂珍,罗杨志,喻运珍,艾桃山.健康和患病克氏原螯虾肠道微生物群落结构和多样性分析[J].水产科技情报,2020,47(1):37-40. |
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作者姓名: | 张立强 李媛 邓平 魏朝辉 丁桂珍 罗杨志 喻运珍 艾桃山 |
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作者单位: | 武汉市农业科学院水产科学研究所,湖北武汉 430223;武汉中博水产生物技术有限公司,湖北武汉 430223;武汉市环境检测中心,湖北武汉 430023;武汉中博水产生物技术有限公司,湖北武汉 430223 |
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基金项目: | 国家特色淡水鱼产业技术体系(CARS—46)。 |
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摘 要: | 为探索健康克氏原螯虾(Procambarus clarkii)与患病克氏原螯虾在肠道微生物菌群结构和多样性方面的差异,采集健康虾(对照组)和患病虾(患病组)样品,通过Illumina高通量测序技术测定样品虾的肠道微生物组成,并利用Simpson指数评估样品中微生物的多样性。结果显示:所有样品共检出400个种水平上的OTUs(operational taxonomic units),归属于25个门(phylum);对照组肠道微生物的优势菌为厚壁菌门(Firmicutes),而患病组的优势菌为变形菌门(Proteobacteria)。进一步分析表明,患病组变形菌门的占比显著高于对照组,Simpson指数提示,患病组的生物多样性较对照组显著下降(P<0.05)。结果表明,患病克氏原螯虾肠道微生物中变形菌门的占比显著上升,生物多样性显著下降(P<0.05)。
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关 键 词: | 克氏原螯虾 肠道微生物 优势菌 生物多样性 变形菌门 |
收稿时间: | 2019/3/18 0:00:00 |
Characterizing the Composition and Biodiversity of Intestinal Microbiota between Healthy and Sick Procambarus clarkii |
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Abstract: | |
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Keywords: | |
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