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健康和患病克氏原螯虾肠道微生物群落结构和多样性分析
引用本文:张立强,李媛,邓平,魏朝辉,丁桂珍,罗杨志,喻运珍,艾桃山.健康和患病克氏原螯虾肠道微生物群落结构和多样性分析[J].水产科技情报,2020,47(1):37-40.
作者姓名:张立强  李媛  邓平  魏朝辉  丁桂珍  罗杨志  喻运珍  艾桃山
作者单位:武汉市农业科学院水产科学研究所,湖北武汉 430223;武汉中博水产生物技术有限公司,湖北武汉 430223;武汉市环境检测中心,湖北武汉 430023;武汉中博水产生物技术有限公司,湖北武汉 430223
基金项目:国家特色淡水鱼产业技术体系(CARS—46)。
摘    要:为探索健康克氏原螯虾(Procambarus clarkii)与患病克氏原螯虾在肠道微生物菌群结构和多样性方面的差异,采集健康虾(对照组)和患病虾(患病组)样品,通过Illumina高通量测序技术测定样品虾的肠道微生物组成,并利用Simpson指数评估样品中微生物的多样性。结果显示:所有样品共检出400个种水平上的OTUs(operational taxonomic units),归属于25个门(phylum);对照组肠道微生物的优势菌为厚壁菌门(Firmicutes),而患病组的优势菌为变形菌门(Proteobacteria)。进一步分析表明,患病组变形菌门的占比显著高于对照组,Simpson指数提示,患病组的生物多样性较对照组显著下降(P<0.05)。结果表明,患病克氏原螯虾肠道微生物中变形菌门的占比显著上升,生物多样性显著下降(P<0.05)。

关 键 词:克氏原螯虾  肠道微生物  优势菌  生物多样性  变形菌门
收稿时间:2019/3/18 0:00:00

Characterizing the Composition and Biodiversity of Intestinal Microbiota between Healthy and Sick Procambarus clarkii
Abstract:
Keywords:
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