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cDNA微阵列分析BALB/c小鼠肝脑组织中差异性表达基因的研究
引用本文:谢文娟,吕国栋,曹琦,李瑶,卢晓梅,马纪,林仁勇,温浩.cDNA微阵列分析BALB/c小鼠肝脑组织中差异性表达基因的研究[J].中国病原生物学杂志,2010(3).
作者姓名:谢文娟  吕国栋  曹琦  李瑶  卢晓梅  马纪  林仁勇  温浩
作者单位:新疆大学生命科学与技术学院;新疆医科大学第一附属医院医学研究中心;新疆包虫病基础医学重点实验室;新疆医科大学第一附属医院医学研究中心新疆包虫病基础医学重点实验室;新疆乌鲁木齐疾病预防控制中心;
基金项目:新疆维吾尔自治区科技支疆项目(No.200891126); 新疆包虫病基础医学重点实验室开放课题(No.XJDX0202-2008-03)
摘    要:目的分析BALB/c小鼠肝、脑组织差异基因表达谱。方法TRIZOL法提取总RNA,反转录cDNA,采用36K小鼠全基因组寡核苷酸芯片,运用荧光双交换方法分析BALB/c小鼠肝脑组织中mRNA转录本含量。经芯片扫描、图像采集后,运用MAS2.0软件对差异基因进行基因功能分析(GO)和KEGG通路分类。结果基因芯片结果表明与脑组织相比,在肝组织中共发现差异表达基因6 132个,其中包括上调基因2 974个,下调基因3 158个,GO分析上述差异表达基因主要涉及代谢、细胞信号转导、DNA结合与转录、细胞周期、细胞骨架、细胞粘附和发育等。KEGG信号通路分析显示:上调差异基因中71个通路的改变差异具有统计学意义(P0.05),下调差异基因中有80个通路的改变差异具有统计学意义(P0.05)。结论小鼠肝与脑组织基因表达谱的差异涉及多个基因表达调控途径,研究这些基因分子功能有助于深入了解各组织独特的功能表达系统。

关 键 词:cDNA微阵列  小鼠      基因  

cDNA microarray analysis of genes differentially expressed in the liver and brain of BALB/c mice
XIE Wen-juan ,LV Guo-dong ,CAO Qi,LI Yao ,LU Xiao-mei ,MA Ji,LIN Ren-yong ,WEN Hao.cDNA microarray analysis of genes differentially expressed in the liver and brain of BALB/c mice[J].Journal of Pathogen Biology,2010(3).
Authors:XIE Wen-juan  LV Guo-dong  CAO Qi  LI Yao  LU Xiao-mei  MA Ji  LIN Ren-yong  WEN Hao
Affiliation:XIE Wen-juan1 2,LV Guo-dong 2,CAO Qi3,LI Yao 2,LU Xiao-mei 2,MA Ji1,LIN Ren-yong 2,WEN Hao 2 (1.College of Life Science , Technology,Xinjiang University,Urumqi 830046,China,2.Medical Research Center , Xinjiang Key Lab for Echinococcosis,First Affiliated Hospital of Xinjiang Medical University,Urumqi 830054,3.Center for Disease Control , Prevention of Urumqi,Urumqi 830000,China)
Abstract:
Keywords:cDNA microarray  mouse  liver  brain  gene  
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