基于CIBERSORT算法研究腰椎间盘突出症中差异基因的免疫浸润及相关中药预测

目的：利用基因芯片数据库对腰椎间盘突出症（LDH）基因探针芯片数据进行富集分析和免疫浸润分析，为深入了解LDH的免疫相关机制提供理论依据。方法:运用R语言及相关安装包程序对LDH差异基因进行KEGG富集分析；通过CIBERSORT反卷法对22类免疫细胞在LDH的含量及比例进行分析；利用COREMINE数据库对显著富集的免疫相关生物学过程及核心靶基因进行中药预测。结果：LDH相关的蛋白网络互作（PPI）核心靶基因涉及PLP1、CD86、NRCAM、FCGR1A、MPO、KIF1A等15个基因。KEGG富集分析显示差异基因与Th17细胞分化、T细胞受体信号通路及炎症相关途径密切相关。LDH免疫细胞的浸润矩阵分析结果表明，巨噬细胞、肥大细胞、调节性T细胞等免疫细胞与正常组存在差异。免疫细胞间相关性分析显示，γδ T细胞与滤泡辅助性T细胞呈正相关关系，中性粒细胞与单核细胞呈负相关关系。COREMINE预测显示，三七、人参、生地黄、枸杞与LDH相关免疫途径及核心靶基因的关系最为密切。结论：巨噬细胞、调节性T细胞与LDH的免疫浸润关系密切，LDH相关的差异基因涉及多种免疫相关生物学过程及通路，筛选...