| 辽宁省首次从急性弛缓性麻痹(AFP)病例分离的一株人腺病毒1型重组株的全基因组序列特征分析 |
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| 引用本文： | 邵玉平,王作虪,任丽萍,陈涛,方兴,任毅,郝爽,王文思,姚文清.辽宁省首次从急性弛缓性麻痹(AFP)病例分离的一株人腺病毒1型重组株的全基因组序列特征分析[J].病毒学报,2021,37(3):596-604. |
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| 作者姓名： | 邵玉平 王作虪 任丽萍 陈涛 方兴 任毅 郝爽 王文思 姚文清 |
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| 作者单位： | 辽宁省疾病预防控制中心,沈阳110005 |
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| 摘 要： | 人腺病毒(Humanmastadenoviruses,HAdV)是一种常见的病毒病原体,在儿科患者中普遍存在.本研究首次报道了 2017年从辽宁省急性弛缓性麻痹(AFP)病例的粪便标本中分离到的一株人腺病毒1型重组株LN2017,并对其全基因组进行测序和分析.我们首先测定了 LN2017的全基因组序列,并将其与从GenBank数据库中下载的来自8个国家的38个参考株一起,构建了基于全基因组、Hexon基因,Penton base基因,Fiber基因和E3基因的系统发育树,并用RDP4.97和SimPlot3.5.1软件进行了重组分析.结果显示,LN2017病毒为HAdV-C亚属,其Hexon,Penton base和Fiber基因与HAdV-1高度相似,但是其E3基因和HAdV-2、HAdV-6高度相似.重组分析显示毒株LN2017是一个重组病毒,在E3基因区域和HAdV-2发生了重组,重组区域位于28045-31042.本研究首次证实了LN2017与 GenBank 中的 JX173080(埃及株 E13)、MH183293(上海株 SH2016)和 MH121110(德国株43C1)具有相同的重组方式,在HAdV-1内构成一个独立的分支.未来,有必要对该分支人腺病毒1型重组株的致病性和临床特征进行进一步研究,并继续加强对HAdV的分子流行病学监测.
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| 关 键 词： | 急性弛缓性麻痹(AFP) 人腺病毒1型重组株 全基因组 E3基因 |
Full-length Genome Analysis of The Recombinant Human Mastadenovirus Type-1 Strain Isolated from Patients with Acute Flaccid Paralysis(AFP)in Liaoning Province,China |
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| SHAO Yuping,WANG Zuoshu,REN Liping,CHEN Tao,FANG Xing,REN Yi,HAO Shuang,WANG Wensi,YAO Wenqing.Full-length Genome Analysis of The Recombinant Human Mastadenovirus Type-1 Strain Isolated from Patients with Acute Flaccid Paralysis(AFP)in Liaoning Province,China[J].Chinese Journal of Virology,2021,37(3):596-604. |
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| Authors: | SHAO Yuping WANG Zuoshu REN Liping CHEN Tao FANG Xing REN Yi HAO Shuang WANG Wensi YAO Wenqing |
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