| 基于转录组测序技术进行静原鸡差异miRNA与mRNA的关联分析 |
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| 引用本文： | 禹保军,虎红红,王卫振,郭菊,黄增文,王影,周子航,顾亚玲,蔡正云,辛国省,张娟.基于转录组测序技术进行静原鸡差异miRNA与mRNA的关联分析[J].基因组学与应用生物学,2021,40(1):42-50. |
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| 作者姓名： | 禹保军 虎红红 王卫振 郭菊 黄增文 王影 周子航 顾亚玲 蔡正云 辛国省 张娟 |
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| 作者单位： | 宁夏大学农学院,银川,750021;宁夏大学生命科学学院,银川,750021 |
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| 摘 要： | 为探究静原鸡肌肉组织肌苷酸沉积过程的分子调控机制,本研究以静原鸡胸肌和腿肌组织作为试验材料,通过转录组测序技术,利用生物信息学分析方法筛选出差异表达miRNA及其靶基因.分析结果表明,静原鸡胸肌和腿肌组织的比较组合中有39个差异表达miRNAs(19个显著上调,20个显著下调).通过miRNA-mRNA互作网络分析可知,一个miRNA可以靶向多个mRNA参与调控多个靶基因的表达.GO富集分析表明,候选靶基因的功能主要富集于三个分支的单一生物过程、细胞内和结构分子活性等.KEGG通路注释表明,候选靶基因显著富集到碳代谢、蛋白酶体通路和氨基酸的生物合成等通路中.选取4个差异表达miRNA的与肌苷酸合成和代谢相关的候选靶基因(POLR2C,GMPR,IMPDH2和APRT)进行实时荧光定量PCR验证,结果表明,定量结果与转录组测序结果趋势一致.该研究结果为阐明地方鸡种肌苷酸特异性沉积过程中miRNA介导的靶基因与肉品风味的关系及其表达分析提供理论依据.
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| 关 键 词： | 静原鸡 转录组测序 肌苷酸 miRNA 富集分析 |
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