辽宁省2007~2012年流行风疹病毒基因特征分析 |
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引用本文: | 王艳,马艳,徐晓婷,范雪松,林茜,隋丹,尹晔,吴凤彤,潘百灵,刘光远,王继健,韩悦,郭军巧,赵卓.辽宁省2007~2012年流行风疹病毒基因特征分析[J].病毒学报,2013(6):589-595. |
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作者姓名: | 王艳 马艳 徐晓婷 范雪松 林茜 隋丹 尹晔 吴凤彤 潘百灵 刘光远 王继健 韩悦 郭军巧 赵卓 |
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作者单位: | 辽宁省疾病预防控制中心;辽宁省大连市疾病预防控制中心;辽宁省鞍山市疾病预防控制中心;辽宁省辽阳市疾病预防控制中心;辽宁省营口市疾病预防控制中心 |
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基金项目: | 国家科技重大专项“传染病监测技术平台”项目(项目编号:2012ZX10004209) |
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摘 要: | 为了解辽宁省2007~2012年流行性风疹病毒基因特征,本研究用Vero/Slam细胞从辽宁省2007~2012年风疹暴发和散发患者的咽拭子标本中分离到145株风疹病毒(Rubella,RV),应用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)扩增RV分离株E1基因的945个核苷酸片段,对扩增产物进行序列测定和分析。将辽宁省145株RV与世界卫生组织(WHO)RV 13个基因型的32株参考株基于739个核苷酸片段的基因定型序列构建基因亲缘性关系树。结果提示,辽宁省2007~2012年145株RV分离株均属于1E基因型,核苷酸和氨基酸同源性为97.2%~100.0%和97.6%~100.0%。与2株WHO 1E基因型参考株(Rvi/Dezhou.CHN/02,RVi/MYS/01)序列相比,核苷酸和氨基酸同源性分别为96.6%~99.2%和98.2%~100.0%.除RVi/Shenyang.Liaoning.CHN/13.11/13株病毒在E1基因的第246位发生了突变(Val246-Ala246);RVi/Shenyang.Liaoning.CHN/13.11/4和RVi/Liaoyang.Liaoning.CHN/26.11/2株病毒在E1基因的第262发生相同突变(Asp262-Asn262)外,其他毒株在N-型糖基化位、血凝抑制位点和中和位点等重要抗原位点均未发生变化,抗原性稳定。辽宁省所有1E基因型风疹病毒在E1蛋白的第338位氨基酸发生相同突变(Leu338-Phe338)。本研究证实1E基因型为辽宁省RV的优势基因型,近6年来辽宁省风疹疫情是由1E基因型RV的多个传播链引起。
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关 键 词: | 风疹病毒 基因特征 基因型 |
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