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甘蔗ATP合酶基因的电子克隆及生物信息学分析
引用本文:张云鹤,曹翠岩,邢慧清,黄赛楠,李玥莹.甘蔗ATP合酶基因的电子克隆及生物信息学分析[J].生物技术,2013(2):34-40.
作者姓名:张云鹤  曹翠岩  邢慧清  黄赛楠  李玥莹
作者单位:沈阳师范大学化学与生命科学学院
基金项目:辽宁省教育厅项目(“甜高粱蔗糖磷酸合成酶基因克隆及表达调控机制的研究”,L2012387)资助
摘    要:目的:运用电子克隆的方法获得甘蔗中的ATP合酶基因。方法:以小麦中一个ATP合酶基因为种子序列,对甘蔗的EST数据库进行搜索,应用相关软件进行聚类分析、拼接组装和延长。结果:获得一个ATP合酶基因SATPC1的cDNA序列全长,该序列长1 415bp,包含一个完整的1 077bp的ORF,编码358个氨基酸,且与水稻、玉米、高粱和葡萄等其他植物的ATP合酶具有高度的同源性。结论:电子克隆获得的cDNA序列为完整的甘蔗ATP合酶基因全长cDNA。

关 键 词:甘蔗  ATP合酶  电子克隆  生物信息学
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