甘蔗ATP合酶基因的电子克隆及生物信息学分析 |
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引用本文: | 张云鹤,曹翠岩,邢慧清,黄赛楠,李玥莹.甘蔗ATP合酶基因的电子克隆及生物信息学分析[J].生物技术,2013(2):34-40. |
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作者姓名: | 张云鹤 曹翠岩 邢慧清 黄赛楠 李玥莹 |
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作者单位: | 沈阳师范大学化学与生命科学学院 |
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基金项目: | 辽宁省教育厅项目(“甜高粱蔗糖磷酸合成酶基因克隆及表达调控机制的研究”,L2012387)资助 |
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摘 要: | 目的:运用电子克隆的方法获得甘蔗中的ATP合酶基因。方法:以小麦中一个ATP合酶基因为种子序列,对甘蔗的EST数据库进行搜索,应用相关软件进行聚类分析、拼接组装和延长。结果:获得一个ATP合酶基因SATPC1的cDNA序列全长,该序列长1 415bp,包含一个完整的1 077bp的ORF,编码358个氨基酸,且与水稻、玉米、高粱和葡萄等其他植物的ATP合酶具有高度的同源性。结论:电子克隆获得的cDNA序列为完整的甘蔗ATP合酶基因全长cDNA。
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关 键 词: | 甘蔗 ATP合酶 电子克隆 生物信息学 |
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