基于数据挖掘分析低氧诱导因子-3α在头颈鳞状细胞癌中的表达及临床意义

目的探讨头颈鳞状细胞癌（HNSCC）患者中低氧诱导因子-3α（HIF-3α）的表达与其DNA甲基化水平的关系，研究HIF-3α表达异常对HNSCC患者预后的影响。 方法以肿瘤基因组（TCGA）数据库为研究基础，分析HIF-3α在530例HNSCC及50例正常头颈组织中的mRNA表达及DNA甲基化水平，独立样本t检验进行统计分析；Pearson相关性分析HNSCC组织中HIF-3α DNA甲基化水平与其mRNA表达之间的关系。Kaplan-Meier生存分析法研究HIF-3α表达与HNSCC患者的总生存率及无复发生存率之间的关系，Log-rank检验进行统计分析。对HIF-3α高表达组与低表达组肿瘤组织进行差异表达基因分析，同时对差异表达基因进行基因富集分析（GSEA），研究其可能参与的生物学功能。 结果与正常组织相比，HNSCC组织中HIF-3α的mRNA表达水平降低，表达量分别为（4.809 ± 0.293）和（3.100 ± 0.092），差异有统计学意义（t= 5.369，P<0.001）；而DNA甲基化水平升高，表达量分别（0.158 ± 0.010）和（0.362 ± 0.009），差异有统计学意义（t= 6.806，P<0.001）；HNSCC组织中HIF-3α的mRNA表达水平与其DNA甲基化水平呈负相关（r=-0.46，P<0.001）；HIF-3α低表达的HNSCC患者总生存率及无复发生存率均显著低于HIF-3α高表达组（HR= 0.701，P= 0.02；HR= 0.517，P= 0.004）；GSEA基因富集分析发现，HIF-3α低表达组和高表达组差异基因主要富集在P53信号通路、凋亡通路和免疫反应通路。互作蛋白分析显示，HIF-3α可能与血管内皮生长因子A（VEGFA）、CREB结合蛋白（CREBBP）等相互作用。 结论HIF-3α在HNSCC中表达降低与其DNA甲基化水平升高密切相关，是潜在的预后预测分子指标。