| 云南地区宫颈癌组织中人乳头瘤病毒18型LCR基因变异特征分析 |
| |
| 引用本文： | 席珏敏,陈俊英,潘玥,文送娇,林垚,王晓丹,叶超,管娇琼,洪珊,孙强明.云南地区宫颈癌组织中人乳头瘤病毒18型LCR基因变异特征分析[J].病毒学报,2018,34(5):707-712. |
| |
| 作者姓名： | 席珏敏 陈俊英 潘玥 文送娇 林垚 王晓丹 叶超 管娇琼 洪珊 孙强明 |
| |
| 作者单位： | 中国医学科学院医学生物学研究所,昆明650118;云南省重大传染病疫苗研发重点实验室,昆明650118;云南省虫媒传染病防控研究重点实验室,普洱665000;中国医学科学院医学生物学研究所,昆明650118;云南省重大传染病疫苗研发重点实验室,昆明650118;云南省虫媒传染病防控研究重点实验室,普洱665000;中国医学科学院医学生物学研究所,昆明650118;云南省重大传染病疫苗研发重点实验室,昆明650118;云南省虫媒传染病防控研究重点实验室,普洱665000;中国医学科学院医学生物学研究所,昆明650118;云南省重大传染病疫苗研发重点实验室,昆明650118;云南省虫媒传染病防控研究重点实验室,普洱665000;中国医学科学院医学生物学研究所,昆明650118;云南省重大传染病疫苗研发重点实验室,昆明650118;云南省虫媒传染病防控研究重点实验室,普洱665000;中国医学科学院医学生物学研究所,昆明650118;云南省重大传染病疫苗研发重点实验室,昆明650118;云南省虫媒传染病防控研究重点实验室,普洱665000;中国医学科学院医学生物学研究所,昆明650118;云南省重大传染病疫苗研发重点实验室,昆明650118;云南省虫媒传染病防控研究重点实验室,普洱665000;中国医学科学院医学生物学研究所,昆明650118;云南省重大传染病疫苗研发重点实验室,昆明650118;云南省虫媒传染病防控研究重点实验室,普洱665000;中国医学科学院医学生物学研究所,昆明650118;云南省重大传染病疫苗研发重点实验室,昆明650118;云南省虫媒传染病防控研究重点实验室,普洱665000;中国医学科学院医学生物学研究所,昆明650118;云南省重大传染病疫苗研发重点实验室,昆明650118;云南省虫媒传染病防控研究重点实验室,普洱665000 |
| |
| 基金项目： | 创新工程项目;重大新药创制"科技重大专项(十二五);国家自然科学基金;神经丛素-B1在介导肿瘤血管新生中的作用机制研究;云南省自然科学基金 |
| |
| 摘 要： | 研究云南地区人乳头瘤病毒18型LCR基因在宫颈癌组织中的变异特点,通过系统发生分析探讨HPV-18变异株的分子流行特征,并通过转录因子结合位点的预测分析LCR变异对病毒感染可能造成的影响。本研究提取了云南地区74例女性宫颈癌组织样本中的DNA,通过PCR、测序、序列比对,分析了9个HPV-18LCR完整DNA序列的基因变异信息,并用Mega 7.0软件使用邻接法进行进化分析,使用JASPAR数据库对可能的转录因子结合位点进行预测。HPV-18LCR序列中发现T7258A、C7529A、G7563A、A7567C、T7592C、A7670T、T7736G、C7764T、C7857T、A41G、C54T、A89C和T104C13个核苷酸点突变,其中最常见变异位点是T7592C,其次是C7857T,突变频率分别为100%和44.4%。9个HPV-18LCR完整DNA序列分属于4个HPV-18LCR变异体,进化树分析显示云南地区流行的HPV-18主要为A系变异体(8个A1亚系,1个A4亚系),HPV-18LCR中T7592C、C7857T变异位于转录因子TBP、HOXA5的结合区域内。云南地区宫颈癌组织中主要流行的HPV-18为A系变异体,T7592C、C7857T是HPV-18LCR中主要变异位点。
|
| 关 键 词： | 人乳头瘤病毒18型(HPV-18) 长控制区 多态性 基因变异 宫颈癌 |
| 本文献已被 CNKI 万方数据 等数据库收录！ |
|
