数据库分析和验证HMMR为乳腺癌的主要生物标志物

目的 筛选并分析乳腺癌的标志性枢纽基因。方法 从GEO数据库下载3个乳腺癌基因表达数据集，筛选乳腺癌中的差异表达基因，venn图取交集；Cytoscape构建PPI网络，获取TOP10枢纽基因；GO功能分析和KEGG通路分析枢纽基因的功能和通路。通过UALCAN和HPA数据库分析了mRNA和蛋白表达水平，通过Kaplan-Meier plotter数据库进行生存分析。QRT-PCR检测验证透明质酸介导的运动受体(Recombinant Hyaluronan Mediated Motility Receptor, HMMR)在乳腺癌细胞中的表达水平。结果 筛选到217个乳腺癌差异表达基因，确定了TOP10枢纽基因；GO功能分析和KEGG通路分析结果显示，TOP10枢纽基因与DNA复制、有丝分裂细胞周期的G1/S转变、有丝分裂细胞周期的G2/M转变相关，并且主要富集在p53信号通路上。经数据库验证，HMMR在乳腺癌中表达上调，并且与临床分期以及生存率负相关。QRT-PCR结果显示，与正常乳腺细胞MCF-10A相比，HMMR mRNA在乳腺癌细胞MCF-7、MDA-MB-231、SKBR3的...