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基于SSR标记的太湖稻区常规粳稻DNA指纹图谱构建及遗传相似性分析
引用本文:罗兵,孙海燕,杨志刚,沈宗根,汤俊,端木银熙.基于SSR标记的太湖稻区常规粳稻DNA指纹图谱构建及遗传相似性分析[J].广西农业科学,2015,46(1).
作者姓名:罗兵  孙海燕  杨志刚  沈宗根  汤俊  端木银熙
作者单位:1. 常熟理工学院 生物与食品工程学院,江苏 常熟 215500;国家杂交水稻工程技术研究中心 常熟分中心,江苏 常熟 215500
2. 常熟理工学院 生物与食品工程学院,江苏 常熟,215500
3. 国家杂交水稻工程技术研究中心 常熟分中心,江苏 常熟,215500
基金项目:江苏省青年科学基金项目,苏州市科技计划项目,常熟市科技计划项目
摘    要:目的]构建太湖稻区粳稻(Oryza sativa L.Subsp.Japonica)DNA指纹图谱,分析粳稻品种间的遗传相似性,为其育种和种子纯度鉴定提供参考.方法]以19份太湖地区优质常规粳稻品种为材料,利用分布于水稻12条染色体上的24对SSR引物构建其DNA指纹图谱,并分析其遗传相似性.结果]24对引物在19份粳稻品种中共检测到99个等位基因,每对SSR引物检测到等位基因1~7个,平均为4.1个.筛选获得能完全区分19份粳稻材料的4对核心引物(RM190、RM18、RM297、RM5414),其在19份粳稻中可扩增获得22个多态性片段;以RM190和RM18区分鉴别粳稻材料的能力最强,可以区别鉴定6个粳稻品种,RM297和RM5414仅能鉴别2个粳稻品种,RM297能鉴别常农粳5号和宁9103,RM5414能区分南粳47和常粳10-9.19份粳稻品种间的遗传相似系数变幅为0.408~0.857,平均为0.605,遗传相似系数在0.500~0.700的材料占81.87%.UPGMA聚类分析结果显示,在遗传相似系数0.550处,19份粳稻材料可聚为两大类群;在遗传相似系数0.620和0.570处,两大类群均可分为两个亚群.结论]太湖地区常规粳稻品种遗传背景相似度高,遗传多样性不够丰富,有待进一步加强引进和利用新的基因资源,创新水稻育种材料.

关 键 词:常规粳稻  DNA指纹构图谱  遗传相似性  太湖地区

DNA fingerprints construction and genetic similarity analysis of conventional japonica rice from Taihu Lake area based on SSR markers
LUO Bing,SUN Hai-yan,YANG Zhi-gang,SHEN Zong-gen,TANG Jun,DUANMU Yin-xi.DNA fingerprints construction and genetic similarity analysis of conventional japonica rice from Taihu Lake area based on SSR markers[J].Guangxi Agricultural Sciences,2015,46(1).
Authors:LUO Bing  SUN Hai-yan  YANG Zhi-gang  SHEN Zong-gen  TANG Jun  DUANMU Yin-xi
Abstract:
Keywords:conventional japonica rice  DNA fingerprint  genetic similarity  Taihu Lake area
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