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大白菜霜霉菌诱导抑制性消减杂交cDNA文库的构建和分析
引用本文:唐永洽,于拴仓,朱月林,张凤兰,余阳俊,赵岫云,张德双.大白菜霜霉菌诱导抑制性消减杂交cDNA文库的构建和分析[J].植物生理学通讯,2010(5):453-458.
作者姓名:唐永洽  于拴仓  朱月林  张凤兰  余阳俊  赵岫云  张德双
作者单位:[1]南京农业大学园艺学院,南京210095 [2]北京市农林科学院蔬菜研究中心,北京100097
基金项目:国家科技支撑项目(2009BADB8B00-03); 大宗蔬菜产业技术体系建设专项资金; 北京市自然科学基金(6102011); 北京市科技计划项目(Z09090501040902)
摘    要:以抗霜霉病大白菜双单倍体系(DH)‘T12-19’为材料,构建了霜霉病诱导表达的正向抑制性消减文库,并利用反向Northern斑点杂交技术对768个阳性克隆进行了筛选,共获得57个病原菌诱导上调表达的克隆。测序后得到55条通读表达序列标签(ESTs),对这些ESTs序列进行聚类和拼接分析,共获得50个unigenes。Blast分析表明,37个unigenes与已知基因高度同源,占全部非重复序列的67.3%。对已知功能基因按MIPS的分类方法进行功能分类,发现这些基因的功能主要涉及物质与能量代谢、转录调控、蛋白质合成与代谢、膜及转运、信号转导、抗病防御等。为了验证文库筛选结果的可靠性,采用实时荧光定量PCR技术分析了其中2个克隆BFCH10和BFIA7的表达谱。结果表明,这2个克隆在接种病菌6h后明显上调表达,与反向Northern斑点杂交结果基本一致。

关 键 词:大白菜  霜霉病  抑制性消减文库  实时荧光定量PCR

Construction and Analysis of Suppression Subtractive Hybridization cDNA Library in Chinese Cabbage(Brassica rapa ssp.pekinensis) Leaves Induced by Peronospora parasitica
TANG Yong-Qia,YU Shuan-Cang,ZHU Yue-Lin,ZHANG Feng-Lan,YU Yang-Jun,ZHAO Xiu-Yun,ZHANG De-Shuang.Construction and Analysis of Suppression Subtractive Hybridization cDNA Library in Chinese Cabbage(Brassica rapa ssp.pekinensis) Leaves Induced by Peronospora parasitica[J].Plant Physiology Communications,2010(5):453-458.
Authors:TANG Yong-Qia  YU Shuan-Cang  ZHU Yue-Lin  ZHANG Feng-Lan  YU Yang-Jun  ZHAO Xiu-Yun  ZHANG De-Shuang
Affiliation:1College of Horticulture,Nanjing Agricultural University,Nanjing 210095,China;2Biejing Vegetable Research Center,Beijing Academy of Agriculture and Forestry Sciences,Beijing 100097,China
Abstract:
Keywords:Brassica rapa ssp  pekinensis  downy mildew  suppression subtractive hybridization(SSH)  realtime PCR
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