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CLIP相关技术的研究进展
引用本文:邢伶越,张彦,黄静,李平,王洋,师明磊,赵志虎.CLIP相关技术的研究进展[J].军事医学科学院院刊,2013(11):867-869.
作者姓名:邢伶越  张彦  黄静  李平  王洋  师明磊  赵志虎
作者单位:[1]安徽大学生命科学学院,合肥230601 [2]军事医学科学院生物工程研究所,北京100071
基金项目:军事医学科学院创新基金资助项目(2012CXJJ033)
摘    要:在真核生物基因表达的转录后调节中,RNA结合蛋白( RBP)起着关键作用,很多RBP的异常与人类疾病的发生密切相关。自2000年的RNA免疫沉淀和芯片分析方法( RNA immunoprecipitation with differential display or microarray analysis , RIP-ChIP)出现以来,人们开始就RBP与RNA相互作用进行了系统而广泛的研究。经过改良和发展,基于体内实时紫外交联免疫沉淀法( ultraviolet crosslinking and immunoprecipitation , CLIP )、交联免疫沉淀cDNA文库高通量测序法( high-throughput sequencing of CLIP cDNA library , HITS-CLIP)、光催化核糖核苷增强交联和免疫沉淀法( photoactivatable-ribonucleoside-enhanced crosslinking and immunprecipitation , PAR-CLIP)以及提高个别核苷酸分辨率交联和免疫共沉淀法( individual nucleotide resolution CLIP , iCLIP)等RIP-ChIP衍生方法相继产生,使用这些方法,可以解析RBP的RNA识别特异性,而且通过与高通量测序技术结合,可以实现转录组尺度的RBP的靶序列的鉴定,分辨率也得到极大提高。该文就RNA与蛋白的相互作用的基本原理及其研究进展、相关技术存在的问题以及发展趋势进行简要综述。

关 键 词:CLIP  紫外交联  免疫沉淀法  RNA结合蛋白质类

Cross-linking and immunoprecipitation assay and its development
XING Ling-yue,ZHANG Yan,HUANG Jing,LI Ping,WANG Yang,SHI Ming-lei,ZHAO Zhi-hu.Cross-linking and immunoprecipitation assay and its development[J].Bulletin of the Academy of Military Medical Sciences,2013(11):867-869.
Authors:XING Ling-yue  ZHANG Yan  HUANG Jing  LI Ping  WANG Yang  SHI Ming-lei  ZHAO Zhi-hu
Affiliation:1. College of Life Sciences, Anhui University, Hefei 230601, China; 2. Institute of Biotechnology, Academy of Military Medical Sciences, Beijing 100071, China)
Abstract:
Keywords:CLIP  ultraviolet crosslinking  immunoprecipitation  RNA-binding proteins
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