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中国红豆杉TcAPLs基因的克隆及表达分析
引用本文:李艳艳,杨艳芳,刘洪伟,王帅,邱德有.中国红豆杉TcAPLs基因的克隆及表达分析[J].中草药,2015,46(10):1512-1519.
作者姓名:李艳艳  杨艳芳  刘洪伟  王帅  邱德有
作者单位:中国林业科学研究院林业研究所,林木遗传育种国家重点实验室,北京100091
基金项目:国家自然科学基金资助项目(31170628, 31300567)
摘    要:目的克隆中国红豆杉altered phloem development(APL)基因,研究APL在中国红豆杉剥皮后树皮再生过程中的表达状况,以揭示其可能的调控作用机制。方法利用反转录PCR(RT-PCR)方法克隆得到3个中国红豆杉APL(TcAPLs)基因的cDNA全长序列,分别命名为TcAPL1、TcAPL2和TcAPL3,进一步利用生物信息学工具对其进行分析,最后利用半定量RT-PCR对中国红豆杉不同组织和qRT-PCR技术对其剥皮再生不同时期的TcAPLs进行表达分析。结果系统进化树结果显示,TcAPL1与TcAPL2编码的蛋白与川桑的APL蛋白亲缘关系最近,聚为一类;TcAPL3处在APL另一个大的独立分支上。组织表达谱分析表明TcAPL1和TcAPL22个基因主要在根、茎、叶片和韧皮部(含形成层)中均高表达;TcAPL3在叶片中表达量较高,而在根和木质部(含形成层)表达较低。在中国红豆杉剥皮再生过程中,TcAPL1和TcAPL22个基因的表达水平随着时间的延长表现为先上升后下降的趋势,均在36 d下降最明显;TcAPL3的表达则在整个组织再生过程中被抑制。结论克隆了3个TcALs基因,3个基因在中国红豆杉剥皮再生过程中均有响应,推测它们在中国红豆杉植物剥皮后组织再生中起一定的调控作用。

关 键 词:中国红豆杉  APL基因  基因克隆  生物信息学分析  表达
收稿时间:2/5/2015 12:00:00 AM

Cloning and expression analysis of TcAPLs in Taxus chinensis
LI Yan-yan,YANG Yan-fang,LIU Hong-wei,WANG Shuai and QIU De-you.Cloning and expression analysis of TcAPLs in Taxus chinensis[J].Chinese Traditional and Herbal Drugs,2015,46(10):1512-1519.
Authors:LI Yan-yan  YANG Yan-fang  LIU Hong-wei  WANG Shuai and QIU De-you
Affiliation:State Key Laboratory of Tree Genetics and Breeding, The Research Institute of Forestry, Chinese Academy of Forestry, Beijing 100091, China;State Key Laboratory of Tree Genetics and Breeding, The Research Institute of Forestry, Chinese Academy of Forestry, Beijing 100091, China;State Key Laboratory of Tree Genetics and Breeding, The Research Institute of Forestry, Chinese Academy of Forestry, Beijing 100091, China;State Key Laboratory of Tree Genetics and Breeding, The Research Institute of Forestry, Chinese Academy of Forestry, Beijing 100091, China;State Key Laboratory of Tree Genetics and Breeding, The Research Institute of Forestry, Chinese Academy of Forestry, Beijing 100091, China
Abstract:
Keywords:Taxus chinensis (Pilg  ) Rehd    APL gene  gene cloning  bioinformatic analysis  expression
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