| 细胞色素酶2D6的分子对接以及分子动力学研究 |
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| 引用本文： | 王靖方,张成城,魏冬青.细胞色素酶2D6的分子对接以及分子动力学研究[J].科学通报,2010,55(1):40-44. |
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| 作者姓名： | 王靖方 张成城 魏冬青 |
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| 作者单位： | ① 中国科学院上海生命科学研究院, 系统生物学重点实验室生物信息中心, 上海 200031;
② 上海交通大学生命科学与技术学院, 生物信息与生物统计系, 上海 200240 |
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| 基金项目： | 国家高技术研究发展计划生物信息专项(编号: 2007AA02Z333)和国家自然科学基金(批准号: 30870476, 20773085)资助项目 |
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| 摘 要： | 细胞色素酶P450是人体内重要的药物代谢酶. 通常, 这类酶在其结构中都含有一个亚铁血红色分子, 并且负责代谢超过90%的已知药物分子. 细胞色素酶2D6是这类酶中的重要一员, 它负责代谢大约20%~30%的已知药物分子. 利用分子对接和分子动力学模拟的方法, 研究了细胞色素酶2D6的结构特征以及其与药物分子之间的相互作用. 并且发现, 细胞色素酶2D6活性位点中的Glu216, Asp301, Ser304和Ala305在其与药物分子的相互作用中有着重要的作用. 它们可以形成一个或者多个氢键来固定药物分子. 同时其活性位点中的Phe120可以通过形成一定的Π-Π相互作用来识别和固定药物分子. 这些发现有助于进一步了解细胞色素酶2D6的结构特征, 特别是其活性位点附近的结构特征, 理解细胞色素酶2D6代谢药物的机理. 同时, 由于细胞色素酶2D6存在着单核苷酸多肽性, 所得到的结果可以为个性化医疗提供一定的理论基础.
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| 关 键 词： | 细胞色素酶 分子对接 分子动力学模拟 药物代谢机理 个性化医疗 |
| 收稿时间： | 2008-11-20 |
| 修稿时间： | 2008-12-19 |
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