| 1株产GES-1型碳青霉烯酶铜绿假单胞菌的全基因组测序分析 |
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| 引用本文： | 郭庆昕,蔡加昌,周宏伟,张嵘,蒋华蔚,胡燕燕.1株产GES-1型碳青霉烯酶铜绿假单胞菌的全基因组测序分析[J].临床检验杂志,2021,39(5):362-366. |
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| 作者姓名： | 郭庆昕 蔡加昌 周宏伟 张嵘 蒋华蔚 胡燕燕 |
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| 作者单位： | 泉州市正骨医院检验科，福建泉州362000;浙江大学医学院附属第二医院检验科，杭州310009;浙江大学医学院附属第二医院血液科，杭州310009 |
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| 基金项目： | 浙江省自然科学基金(LY20H200006，LQ17H160007)。 |
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| 摘 要： | 目的了解产GES-1型碳青霉烯酶铜绿假单胞菌的分子流行特征。方法采用Illumina HiSeq X10测序平台对1株产GES-1型碳青霉烯酶铜绿假单胞菌进行全基因组测序,通过Kleborate和ResFinder分析菌株的多位点序例分型(MLST)、毒力基因和抗菌药物耐药基因,并分析bla_(GES-1)基因的周围环境。结果经比对,本菌为ST235型,血清分型为O11型,共携带12个抗菌药物耐药基因,分别为aac(6′)-Ⅰb3、aadA10、aph(3′)-Ⅱb、aph(3′)-XV、bla_(GES-1)、bla_(OXA-50)、bla_(PAO)、crpP、sul1、tet(G)、fosA、catB7;bla_(GES-1)位于含有3 150 bp的NODE_219片段中,该片段与GenBank中的KY860573菌株的72068—75217序列99.94%一致。其基因环境为位于上游的整合子1(intl1),β-内酰胺类耐药基因bla_(GES-1),氨基糖苷类/氟喹诺酮类耐药基因aac(6′)-Ⅰb3,氨基糖苷类耐药基因aph(3′)-XV及位于下游的插入序列ISPa21e。该菌包含有357个毒力基因,为exoU~+/exoS~-基因型。结论本菌为全球流行的高风险克隆ST235,exoU~+/exoS~-基因型。全基因组测序分析提供了bla_(GES-1)基因环境、基因分型、耐药基因、毒力基因等多种信息。
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| 关 键 词： | 碳青霉烯酶 铜绿假单胞菌 blaGES-1 基因环境 全基因测序 |
| 收稿时间： | 2021/1/18 0:00:00 |
Whole genome sequencing analysis of a strain of Pseudomonas aeruginosa producing GES-1 carbapenemase |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | carbapenemase Pseudomonas aeruginosa blaGES-1 gene environment whole genome sequencing |
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