| 苏云金芽胞杆菌转录调控因子CodY的体外靶基因的筛选 |
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| 引用本文： | 梅菲,齐明霞,李明顺.苏云金芽胞杆菌转录调控因子CodY的体外靶基因的筛选[J].微生物学报,2016,56(7):1178-1185. |
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| 作者姓名： | 梅菲 齐明霞 李明顺 |
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| 作者单位： | 华中农业大学生命科学技术学院, 农业微生物学国家重点实验室, 湖北 武汉 430070,华中农业大学生命科学技术学院, 农业微生物学国家重点实验室, 湖北 武汉 430070,华中农业大学生命科学技术学院, 农业微生物学国家重点实验室, 湖北 武汉 430070 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金(30900016);湖北省自然科学基金(2014CFB931) |
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| 摘 要： | 【目的】利用Avi-tag和Pulldown技术建立体外靶基因筛选的新方法,在苏云金芽胞杆菌YBT-1520基因组范围内进行体外高通量筛选转录调控因子CodY的靶基因,为深入研究CodY在苏云金芽胞杆菌中的功能及调控网络打下基础。【方法】用Avi-tag技术对CodY蛋白进行体外生物素标记,酶切苏云金芽胞杆菌YBT-1520总DNA并在两端加上便于测序的adapter序列,用链霉亲和素树脂筛选与CodY蛋白相互作用的靶基因。【结果】在苏云金芽胞杆菌中得到了46条CodY可以直接作用的靶序列,分析发现CodY在苏云金芽胞杆菌中主要调控氨基酸代谢、糖代谢、脂肪酸代谢、转运、调控、DNA修复、双组份调控等的转录。【结论】本研究采用的Avi-tag技术具有特异性强、操作简单、成本低等优势,为转录因子体外靶序列的高通量筛选提供新的方法;苏云金芽胞杆菌中CodY靶基因的筛选为其他微生物中CodY的功能研究打下基础。
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| 关 键 词： | CodY 靶基因 Avi-tag技术 苏云金芽胞杆菌 生物素 调控 |
| 收稿时间： | 2015/10/15 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2016/1/24 0:00:00 |
Genome-wide identification of CodY target genes in Bacillus thuringiensis by in vitro binding analysis |
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| Fei Mei,Mingxia Qi and Mingshun Li.Genome-wide identification of CodY target genes in Bacillus thuringiensis by in vitro binding analysis[J].Acta Microbiologica Sinica,2016,56(7):1178-1185. |
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| Authors: | Fei Mei Mingxia Qi and Mingshun Li |
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| Affiliation: | State Key Laboratory of Agricultural Microbiology, College of Life Science and Technology, Huazhong Agricultural University, Wuhan 430070, Hubei Province, China,State Key Laboratory of Agricultural Microbiology, College of Life Science and Technology, Huazhong Agricultural University, Wuhan 430070, Hubei Province, China and State Key Laboratory of Agricultural Microbiology, College of Life Science and Technology, Huazhong Agricultural University, Wuhan 430070, Hubei Province, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | CodY target genes Avi-tag technology Bacillus thuringiensis biotin regulation |
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