首页 | 官方网站   微博 | 高级检索  
     

一种基于模糊聚类的构造进化树方法
引用本文:李刚成,刘赞波,曾庆光.一种基于模糊聚类的构造进化树方法[J].计算机应用,2009,29(3):836-838.
作者姓名:李刚成  刘赞波  曾庆光
作者单位:1. 湖南信息职业技术学院,信息工程系,长沙,410200
2. 湖南大学,计算机与通信学院,长沙,410082
摘    要:各种生物之间的进化史可以通过构建进化树来讨论,因此进化树的研究成了一个研究热点。提出将利用DNA序列的4D表示所得相似矩阵视为模糊矩阵,再利用最大树法来构建进化树的方法。该方法不需要多序列比对,计算简单,实验验证了该方法的有效性。

关 键 词:DNA序列  进化树  模糊理论  聚类分析  最大树法
收稿时间:2008-09-16

Method of constructing phylogenetic tree based on fuzzy clustering
LI Gang-cheng,LIU Zan-bo,ZENG Qing-guang.Method of constructing phylogenetic tree based on fuzzy clustering[J].journal of Computer Applications,2009,29(3):836-838.
Authors:LI Gang-cheng  LIU Zan-bo  ZENG Qing-guang
Affiliation:1.Department of Information Engineering;Hunan College of Information;Changsha Hunan 410200;China;2.School of Computer and Communication;Hunan University;Changsha Hunan 410082;China
Abstract:The evolutionary history of various species can be disscussed by constructing the phylogeny trees. Therefore, many scientists focus on the research of the phylogeny trees. In this paper, the authors used the similarity matrix computed by 4D representation of DNA sequence and regarded it as a fuzzy matrix, then used the maximal tree method to construct the phylogeny tree. This method need not sequence alignment and the computation is simple. The experiments demonstrate its validity.
Keywords:DNA sequence  phylogenetic tree  fuzzy theory  cluster analysis  maximum tree method
本文献已被 CNKI 维普 万方数据 等数据库收录!
点击此处可从《计算机应用》浏览原始摘要信息
点击此处可从《计算机应用》下载全文
设为首页 | 免责声明 | 关于勤云 | 加入收藏

Copyright©北京勤云科技发展有限公司    京ICP备09084417号-23

京公网安备 11010802026262号