生物医学知识整合论(X)

本文从联结度演化的角度描述了人工智能各种知识表达的关系。还讨论了人工智能领域(AI)和数学领域旷日持久的哲学争论与生物医学知识整合论(BMKI)在生物医学知识属性探讨中发现、提出和得出的一系列讨论或结论的同源性、对应性、互析(晰)性。并首次提出如下新概念：准无穷概念及其在理性与非理性相互转化中的作用；准物理性知识概念及其对物理系统的开放性、不可确定性的依附性；“大或空闻”概念及其与科学联想的关系等。笔者相信在生物医学信息学(BMI)的知识工程学的发展中，将不可避免地会遇到这些新概念。     

p63与头颈部鳞癌

随着p53基因的广泛和深入研究，p53家族的新成员p63与p73陆续被发现。本就p63的表达类型、结构、功能及与头颈部肿瘤的相关性作一综述。p63基因定位于染色体3q27-29，与p53有高度的同源性，与p53不同的是其可以编码多种蛋白质。发现p63主要表达鳞状上皮源性的恶性肿瘤。     

用DNAG C含量和DNA同源性测定法鉴定米克戴德军团菌

本文采用热变性温度法和液相复性速率法对—轻型特征及血清学反应相似米克戴德军团菌(Lm)的菌株进行了测定,结果表明该菌与标准Lm(C DC株)的DNA G Cmol％相差3.45％,与标准Lm(C DC株)的DNA同源性达81.99％,根据伯杰细菌鉴定手册(1984),可判定该菌株与标准Lm(C DC株)为遗传型一致的类群,即从遗传学角度证明该菌为Lm。     

病毒与人类基因组同源性实探

探讨病毒与人类基因组同源性问题。选用ＥＢ病毒（ＥＢＶ），肠道病毒（ＥＶｓ）、单纯疱疹病毒－１型（ＨＳＶ－１），丙型肝炎病毒（ＨＣＶ）特异性引的，以６份健康成人外周血ＤＮＡ为模板，分别进行酶链式反应（ＰＣＲ）。初步结果表明，有５份ＤＮＡ样品可通过ＥＢＶ、ＨＣＶ特异性引物扩增，ＥＢＶ引物扩增后的片段大小在１５４－２３４ｂｐ之间；ＨＣＶ引物扩增的片段大小约２００ｂｐ和１２０ｂｐ。提示病毒某些基因可能存在     

真菌免疫调节蛋白的研究进展

真菌免疫调节蛋白(Fungal immunomodulatory protein，Fip)是近年来从一些高等担子菌(蘑菇类)子实体中提取的与植物凝集素和免疫球蛋白的结构和免疫功能相似的一类小分子蛋白质。自1989年Kino等从赤灵芝子实体中分离提取出第一种真菌免疫调节蛋白(LZ-8)以来，目前已分别从赤灵芝，松杉灵芝，金针菇和草菇中的子实体中提取出4种真菌免疫调节蛋白，它们的氨基酸组分别具有60％～70％的同源性，并且具有相似的免疫生物学活性。根据这4种真菌免疫调节蛋白的氨基酸序列，     

霍乱弧菌的一种新的不含毒素基因CTXΦ基因组的复制功能研究

引起霍乱流行的霍乱弧菌菌株在遗传方面的一个重要特点是都带有霍乱毒素（CT）的基因ctxAB.对O139群菌株的分析中，发现一种新的不含ctxAB的CTXΦ基因组，其中的rstR基因和ig-2区与已发现的CTXΦ基因组的相应序列无明显同源性，     

基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱在车间洁净室污染同源性分析中的应用

目的调查车间洁净室的微生物污染来源。方法对车间的空气,环境和人员进行微生物采样和培养,然后使用MALDI-TOF-MS进行检测,并使用仪器配套的微生物鉴定系统进行同源性分析。结果共检出14种41株细菌。选择9株表皮葡萄球菌进行同源性分析,来源于人员手套和头套上的表皮葡萄球菌有94.00%的同源性。来源于沉降菌和地面环境及人员的表皮葡萄球菌之间有83.00%的同源性,均较标准菌株的71.00%为高。结论同源性分析证明车间洁净室的污染主要来自人员,其次来源于车间外环境。企业需要加强管理,防范微生物污染的发生。MALDI-TOF-MS可应用于快速检测复杂的环境菌并进行同源性分析。     

青岛地区TTV抗体阳性人群的病毒基因检测及序列分析

（1）目的 了解经血传播病毒（TTV）在青岛地区的基因变异情况。（2）方法 选择TTV抗体阳性的标本,用巢式PCR技术扩增血清中的DNA特定片段,纯化后与载体连接并转入大肠杆菌JM109,提取阳性克隆的重组质粒测序并与TTV的已知序列相比较。（3）结果 在选择的20例标本中,15例扩增出TTV DNA,对其中1株测序后与已知序列AB008394比较,发现碱基变异率为13．3％。（4）结论 青岛地区存在TTV变异株。     

日本血吸虫尾蚴(中国大陆株)表达序列标签的获取及同源性分析

目的 了解日本血吸虫尾蚴ｃＤＮＡ文库中基因的基本情况,为新基因的筛选鉴定提供依据。方法 日本血吸虫尾 蜘ｃＤＡＮ文库中的噬菌体侵入大肠杆菌ＢＭ２５．８后环化成质粒。筛选出已转入质粒的菌株。提取质粒ＤＮＡ,用质粒上 的一段测序引物序列进行一次性测序,得到一个表达序列标签（ＥＳＴ）。通过ＢＬＡＳＴｘ及ＢＬＡＳＴｎ公共数据库经编辑分 析的ＥＳＴ序列进行同源性比较。经过分析编辑后的新ＥＳＴ序列,以编写好的程序和Ｅ－ｍａｉｌ方式递交,以获得ＧｅｎＢａｎｋ 登录号。通过对同源性比较结果的总结,对该文库的基本情况进行分析。结果与结论 在测出的５８个ＥＳＴ中有３个核 苷酸序列与日本血吸虫已知基因高度同源,有２个核苷酸序列与曼氏血吸虫较高度同源,有７个ＥＳＴ的蛋白质序列与 其他物种有较高同源性而核苷酸序列同源性很低,有２７个ＥＳＴ的蛋白质及核苷酸序列同源性都很低。     

耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌产酶耐药机制及同源性分析

目的探讨肺炎克雷伯菌对碳青霉烯类抗菌药物耐药的主要产酶机制及同源性。方法收集长沙市第一医院2016年12月-2017年12月临床分离的非重复碳青霉烯耐药肺炎克雷伯菌(CRKP),采用改良碳青霉烯酶灭活试验(mCIM)检测碳青霉烯酶,聚合酶链反应(PCR)法检测常见耐药编码基因。脉冲场凝胶电泳(PFGE)和多位点序列分型(MLST)分析同源性。结果共收集到57株CRKP,mCIM试验阳性率为91.23%(52/57)。PCR共检出6种耐药基因,包括blaSHV、blaCTX-M-9群、blaKPC-2、blaTEM、blaCTX-M-1群和blaNDM-1,检出率分别为94.74%、68.42%、68.42%、56.14%、3.51%和1.75%,其中2株携带blaCTX-M-1群的菌株经测序证实为blaCTX-M-80和blaCTX-M-123,blaCTX-M-9群中1株为blaCTX-M-27,2株为blaCTX-M-14,其余均为blaCTX-M-65。PFGE结果显示,57株CRKP可分为A~H共8种不同的型别,以A型为主,占76.79%,其中A6亚型占32.56%。MLST结果显示,共检出ST11和ST29两种型别,以ST11为主,占75.00%。结论该院临床分离的肺炎克雷伯菌对碳青霉烯类抗菌药物耐药的重要机制为产KPC-2型碳青霉烯酶,且同时携带多种超广谱β-内酰胺酶(ESBLs)耐药基因。PFGE和MLST结果表明:该院临床分离的CRKP存在克隆传播,需加强流行病学监控。