基因组高通量测序数据结构变异识别算法

遗传变异是生命的基本特征,遗传变异与表型差异之间的关系,是现代生物学的一个基本问题。由基因决定生物体的遗传特征和主要个体差异的观念正在逐渐改变,过去几年的许多研究显示,基因组中大尺度的结构变异与个体的表型差异和疾病等有一定的关联。有关遗传变异和表型多样性的研究,需要比较生物体个体基因组间的各种不同。利用NGS数据全面分析结构变异的技术目前仍然不成熟。因此本文根据生物学知识,利用高通量测序数据,对植物基因组结构变异的识别问题深入系统的研究,提出新的结构变异识别方法和精确的断点预测方法。     

CPL: Detecting Protein Complexes by Propagating Labels on Protein-Protein Interaction Network

Proteins usually bind together to form complexes, which play an important role in cellular activities. Many graph clustering methods have been proposed to identify protein complexes by finding dense regions in protein-protein interaction networks. We present a novel framework （CPL） that detects protein complexes by propagating labels through interactions in a network, in which labels denote complex identifiers. With proper propagation in CPL, proteins in the same complex will be assigned with the same labels. CPL does not make any strong assumptions about the topological structures of the complexes, as in previous methods. Tile CPL algorithm is tested on several publicly available yeast protein-protein interaction networks and compared with several state-of-the-art methods. The results suggest that CPL performs better than the existing methods. An analysis of the functional homogeneity based on a gene ontology analysis shows that the detected complexes of CPL are highly biologically relevant.     

而今迈步从头越——深圳石化集团探索综合商社改革道路纪实

1995年12月29日晚,深圳会堂。 深圳石化集团庆祝荣获全国质量效益型先进企业“四连冠”暨综合商社试运转动员大会在此举行。会上,深圳市体改办张思平主任宣读了《关于深圳石化集团综合商社试运转方案的批复》,并正式宣布: 深圳石化集团综合商社1996年进入试运转!     

领跑于世界前沿的存储器测试技术

近几年,中国半导体存储器市场一直保持高速地增长,数字系统和产品以及移动通信的发展都是半导体存储器市场增长的主要推动力。本文着重讲述了当今主流半导体存储器的先进测试方法。此外,本文对半导体存储器及其发展趋势,以及存储器的测试系统也做了简单的介绍。     

元认知策略在非英语专业学生阅读学习中的应用

作为学习策略的一种,元认知策略的运用可以有效提高学生的阅读水平。因此,培养学生在阅读中使用该策略成为一种必要。根据元认知策略的理论,本研究针对非英语专业学生的阅读进行了一学期的元认知策略培训。结果发现元认知学习策略可以有效提高非英语专业学生的阅读水平,其中元认知策略中的监控阅读过程策略与阅读成绩的提高相关性最明显。     

PGA算法解相位污染虚假目标问题的研究

电离层相位污染使天波超视距雷达(OTHR)回波信号的多普勒谱展宽,从而严重影响了雷达对目标的检测性能.相位梯度法(PGA)是现有的一种性能较好的解污染算法,但是当Bragg峰附近存在目标时,解污染后的回波谱会出现虚假目标,这严重影响了PGA算法的实际应用.本文从理论上分析了虚假目标的成因,提出采取分别利用正负Bragg峰进行PGA处理的方法,从而能有效地检测出这种情况下的真实目标.最后,本文给出了仿真结果,证明了该方法的有效性.     

双馈风电系统网侧变流器控制策略的改进

在传统的矢量控制策略下,当电网电压发生三相对称短路故障时双馈感应发电机(DFIG)变流器直流母线电压会产生剧烈波动,从而影响整个风电系统的稳定运行。为此,需要对DFIG网侧变流器控制策略进行改进。分析了电网电压三相对称跌落时引起直流母线电压波动的原因,并在此基础上提出了新型的前馈控制方法。当电网电压跌落时对网侧变流器电流参考值做必要修正,从而达到减小直流母线电压波动的目的。为了验证该控制方法的有效性,在PSCAD/EMTDC软件环境下建立了容量为2MW的DFIG风电系统模型,并在此模型下进行系统仿真。仿真结果显示,提出的前馈控制策略能够有效的减小直流母线电压的波动。     

胜25井区沙四段储层特征及主控因素分析

通过对胜25井沙四段碎屑岩储层的岩石学特性、物理特征、储集空间和孔隙结构等特征进行研究分析,得出该区储层岩性主要以砾岩、砂砾岩、含砾不等粒砂岩为主的结论.本区砂岩储层的主要成岩作用类型有:机械压实作用、溶蚀作用、交代作用.这些成岩作用都在一定程度上对砂岩的储集性能起改造作用.因此次研究的沙四段埋深比较大,所以压实作用对本区储层物性的影响较大.孔隙类型中原生粒间孔隙极少,次生孔隙在工区内分布较普遍,其中尤以岩屑、长石或少量石英颗粒内的粒内溶孔最普遍,粒间溶孔和填隙物内溶孔也较发育.岩石微裂缝发育较少岩心中宏观裂缝规模较小,充填程度高.孔隙通道个别数据点数值很高,说明储层非均质性较强,存在物性好的局部区域.     

内蒙古呼伦贝尔市克一河镇一带土壤地球化学特征及其找矿意义

内蒙古呼伦贝尔市克一河镇一带为原始森林覆盖区,露头出露极差,通过对该区1315km^2内的10723件土壤样品分析研究表明,该区是金、银、钼的重要成矿靶区,而且该区内上侏罗统满克头鄂博组、白音高老组及早白垩世花岗斑岩是上述矿种的主要成矿母源层,本次土壤地球化学特征研究为该地区找矿起到了重要的指示作用。     

基于读分割最优匹配的indels识别算法

高通量测序技术的发展极大地推动了基因组结构变异识别的研究,当前该领域主要是针对覆盖度、双末端读对、或片段组装方法来识别变异,但这些方法的识别结果不够准确、敏感度高、对基因组结构变异的信息（如变异序列,变异坐标等）挖掘不充分.插入和删除类型的结构变异统称为indels,是基因组结构变异种最常见的变异.为此,本文针对indels的精确识别提出了基于split-read思想和动态规划策略的最优序列匹配算法（OptimalSplit-read Matching Algorithm,OSRM）.OSRM算法能将异常read以最少的空位打断比对到参考序列上.首先建立异常read与特定参考序列的匹配得分矩阵,然后建立回溯路径矩阵,最后用以变异特点设计的得分公式,对每条路径进行最优匹配结果的筛选,输出精确识别的indels的坐标及序列,实验结果显示,该方法对小中型的indels有很高的识别性能.此外,与split-read领域最经典的算法Pindel进行了比较,证实了算法在小中型的indels识别方面有更好的效果,可以对更加复杂的情况进行识别.