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1.
针对DNA编码序列设计问题,将其转换为带约束的多目标优化问题,在单链DNA集合中引入h-距离,构造了DNA序列间的共享函数,应用小种群遗传算法,对DNA编码序列设计问题进行求解。与已有结果比较,算法可以得到更好的DNA序列且计算效率较高。算法可用于DNA计算中编码序列的具体设计。  相似文献
2.
DNA编码优化问题是DNA计算中的核心问题。分析DNA编码优化的约束条件,在单链DNA序列集合上引入h距离,将聚类小生境技术应用于小种群遗传算法的构造,对DNA编码优化问题进行求解。基于h距离定义DNA序列间的相似函数,将碱基字母编码为4进制整数、DNA编码序列作为个体编码为4进制整数向量、种群编码为4进制整数矩阵,基于模4算术运算,构造相应的遗传算子,并给出DNA编码序列的具体计算结果。实验结果表明,与现有DNA编码序列优化结果相比,该算法可得到更好的DNA编码序列且计算效率较高。  相似文献
3.
在DNA算术运算的模型中普遍应用二进制,受制于进位的影响,难以实现并行运算。但在剩余数制中,算术运算(加、减、乘)在剩余位之间不存在进位,故可降低运算过程的复杂度,可以充分利用DNA计算巨大并行性的优势,简化实际编码的难度。基于Adleman-Lipton模型,分析了剩余数制的基本原理,基于特定的模数集,改进了整数的DNA链表示,并将其应用于DNA算术运算,给出了特定剩余数制下进行并行DNA算术运算的具体算法。  相似文献
4.
在DNA算术运算的理论模型中,普遍应用固定基数制,比如二进制、三进制。但是由于受到进位的影响,难以实现并行运算。基于Adleman-Lipton模型,分析了剩余数制的基本原理,改进了整数的DNA链表示,并将其应用于DNA算术运算,给出了剩余数制下进行DNA算术运算的算法模型。由于在剩余数制中,算术运算(加、减、乘)在剩余位之间无须进行进位计算,故可以降低运算过程的复杂度,而且有利于进行各个剩余位上的并行计算。  相似文献
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