用非线性预测方法研究蛋白质序列的特性(Ⅰ)

通过详细HP模型将一条蛋白质序列构造为3个特征序列.其中蛋白质序列取自蛋白质分类数据库CATH,该库将蛋白质序列根据不同结构域分为4类(α主类,β主类,αβ类,低二级结构类).然后采用非线性预测方法,研究每类蛋白质序列的特征序列,得到特征序列的误差比值(E-D)图.从图形上发现,每类蛋白质序列的每条特征序列的曲线起伏波动不断,具有特异性,且4类蛋白质序列对应特征序列的E-D图之间也有很大不同.     

基于OneNet云平台的智慧平安校园远程监控系统

多数学校已具备智慧平安校园的软硬件条件,但各自为政、信息分散,难以统一管理。基于OneNet云平台的物联网解决方案,构建了集云端数据通信、远距离监控、灯光控制、安防、智慧学习功能于一体的智慧平安校园监控系统。采用OneNet云端接入技术实现数据存储和处理,采用状态迁移算法有效提高了指令执行的成功率和响应度。测试结果表明,用户可通过移动APP对校园安全情况进行高效、实时、准确、可靠的远程监控。该设计方案可成功应用于智慧平安校园管理等多个领域。     

关于入侵物种三联密码子的基因签名

寡核苷酸的频率分布具有物种特性,可看作是一种基因签名.本文计算一些入侵植物中部分DNA序列的三联密码子出现频率,并将此频率分布用二维平面图和一维柱状图表示,作为物种的基因签名.通过对不同入侵物种基因签名的分析比较,发现入侵物种的DNA序列非随机,基因签名具有物种特性,且物种越近,签名越相似.同时签名有局部相似性的,物种在某方面也具相似性.即签名可在一定程度上表征物种的分类和进化关系.另外,鉴于生物入侵过程实际上是快速进化过程,采用人工基因突变的方法将原始DNA序列转化为突变序列,并将原始序列和突变后序列的基因签名作比较,发现DNA序列三联密码子出现频率具有分布差异,这些差异可导致对应蛋白质结构和功能的改变,进而改变物种特性.     

用非线性预测方法研究蛋白质序列的特性(Ⅱ)

为了研究蛋白质序列的内在特性,通过非线性预测方法将蛋白质序列和随机序列以及混沌序列进行比较.前期研究可知:每条蛋白质序列的每个特征序列的误差比值(E-D)图具有特异性,和随机序列的E-D图相比具有明显差异.另外每条蛋白质序列的E-D图曲线大体都在1附近波动,波动走势没有任何规律可言.通过与给定混沌序列的E-D图相比较,发现两者之间具有相似的特性.由此得出:蛋白质序列具有非随机性,可能具有非线性(混沌)性.     

基于蛋白质CGR的线粒体蛋白质序列比对

利用蛋白质混沌游走表示法（PCGR）提出一种新的蛋白质序列比对方法。通过计算两序列之间的PCGR点距离,就可以找到所有的局部相似片断。根据氨基酸的化学物理性质把氨基酸分成4和7类,针对分类与无分类的各种情况进行蛋白质序列比对。为了更直观地描述比对结果,采用点阵图来表示比对数据,不仅能显示两序列间所有相同片断,还可以体现出序列的相似性。