宏基因二代测序技术在非结核分枝杆菌感染的病原学诊断效能比较

目的：研究宏基因病原二代测序技术及传统培养法对非结核分枝杆菌的检出率差别,探讨宏基因检测法对非结核分枝杆菌病的病原学诊断价值。方法：回顾性收集2018年9月-2019年12月期间我院收治的非结核分枝杆菌检测阳性的病例共388例,比较传统培养法及宏基因检测法的阳性率差异及不同样本类型的亚组分析。结果：培养法及mNGS阳性率均不足50%,两者阳性率比较无统计学差异。对于痰液标本,培养法的阳性率明显高于mNGS检测法（56.6% vs 22.9%,p<0.0001）;相反,对于组织标本,培养法的阳性率明显低于mNGS检测法（7.8% vs27.8%,p<0.0001）。宏基因检测的各类标本中,肺泡灌洗液的检测阳性率高于其他标本,差异有统计学意义,p=0.01。结论：mNGS是一项具有前景的研究,但是在NTM的病原学检测领域敏感性较低,需重点改进以促进此技术更好的应用于临床。     

基于胸部CT影像学表现的肺部感染病原体的评估和甑别

肺部感染是最常见的感染性疾病,早期快速、准确的病原学诊断、精准治疗是改善肺部感染预后、降低死亡率的关键。不少特定病原体引起的肺部感染病灶,在胸部CT表现具体一定的特征。根据病灶形态、大小、数量、变化速度,可评估和甑别引起肺部感染可能的病原体。本文介绍肺部感染相关的胸部CT常见和重要的影像学特征,以提升临床医生对评估肺部感染病原体、合理使用抗菌药物和改善肺部感染预后的能力和重视。     

第76例 发热—干咳—右膝关节肿痛—双侧胸腔积液伴左侧液气胸—类鼻疽伯克霍尔德菌感染

病历摘要患者男,52岁,因发热、干咳10d,右膝关节疼痛8d,于2003年入院。患者2003年11月21日因头痛、发热、干咳1d就诊于当地医院,当时体温38.7℃,无胸闷、气急及呼吸困难,无盗汗。血常规:白细胞18×109/L,中性粒细胞0.82。X线胸片:两下肺炎性阴影。B超:左侧少量胸腔积液。予阿奇霉素、头孢他啶、左氧氟沙星等抗感染治疗后,体温仍波动于39℃左右。为进一步治疗转来本院。既往有高血压病史3年。入院体格检查:体温39.3℃,脉搏90次/min,呼吸20次/min,血压110/80mmHg(1mmHg=0.133kPa)。神志清,皮肤巩膜无黄染,无紫绀,浅表淋巴结未及肿大。两肺…     

宏基因二代测序技术对脊柱感染病原学诊断的价值

目的:探讨宏基因二代测序(metagenomic next-generation sequencing,mNGS)技术对脊柱感染病原学诊断的价值。方法:回顾性分析2018年1月至2019年12月复旦大学附属中山医院收治的24例疑似脊柱感染患者的病例资料,采用常规微生物培养法和mNGS技术检测脊柱组织标本。结果:mNGS总体检测阳性率高于常规培养法(62.5%vs 35.0%),mNGS平均耗时36～48 h,明显短于常规培养法的平均天数21.8 d。脊柱感染主要检出病原体为结核分枝杆菌、金黄色葡萄球菌、大肠埃希菌。结论:mNGS能够快速检测脊柱感染病原体,为临床早期精准治疗提供重要的病原学依据。     

基于胸部CT影像学表现的肺部感染病原体的评估与甄别

肺部感染是造成死亡人数最多的感染性疾病,早期快速、准确的病原学诊断、精准治疗是改善肺部感染预后、降低死亡率的关键。有些病原体引起的肺部感染病灶,可在胸部CT表现出一定的特征。因此,根据病灶形态、大小、数量、变化速度,临床可评估和甄别引起肺部感染可能的病原体。本文就肺部感染相关胸部CT常见和重要的影像学特征进行述评,旨在提升临床医生对评估肺部感染病原体、合理使用抗菌药物及改善肺部感染预后的能力。     

免疫受损大鼠铜绿假单胞菌肺部感染VE-cadherin的变化及其意义

目的　通过建立免疫受损 (ICH)铜绿假单胞菌 (PA)肺炎大鼠模型 (ICH组 ) ,并与正常大鼠PA肺炎 (对照组 )比较 ,检测肺血管内皮钙粘蛋白 (VE cadherin)的动态表达 ,以明确VE cadherin是否参与ICH肺部PA感染肺微血管损伤机制及其意义。方法　用环磷酰胺 (15mg·kg- 1·d- 1)联合醋酸可的松 (10 0mg·kg- 1·d- 1)建立ICH大鼠模型 ,通过气管内注入PA溶液 (0 2mlATCC2 78536× 10 8CFU/ml)复制肺部PA感染模型。采用免疫点印迹方法测定血清、支气管肺泡灌洗液 (BALF)中VE cadherin的含量 ,免疫组化 (二步法 )测定肺组织VE cadherin的表达。结果　两组血清VE cadherin的表达在各个时间点差异较少 ,表达稳定 ,两组对比无明显差异 (P >0 0 5)。灌洗液中VE cadherin的含量时序分析显示 ,感染前两组均有一定量的表达 ;感染后均出现下降 ,ICH组感染后3h和 6h最为明显 (P <0 0 5) ,感染后 9h呈上升趋势 ;对照组在感染后 6h出现最低点 ,各时间点表达与感染前无明显差别。肺组织的VE cadherin在感染前两组肺组织中均有少量表达 ;ICH组在PA感染 6h后呈下降趋势 ,感染PA后各时间点的VE cadherin阳性细胞数与感染前相比 ,无统计学意义(P >0 0 5) ;正常对照组PA感染后VE cadherin阳性细胞数呈增多趋势 ,但组间差异较小     

肺隐球菌病并发细菌性脓胸诊治体会

临床资料患者男性 ,36岁。因咳嗽 2月余 ,发热 1月余 ,体温最高达 38.5℃ ,1个月前在本院门诊就诊。胸片示 :“左下肺背段团块状影” ,胸部CT示 :“左下肺炎性病变 ,结核待排 ,纵隔及肺门淋巴结无明显肿大。”痰找病理细胞、抗酸杆菌多次 (- ) ,门诊予以头孢曲松 2 g静滴 10d ,症状未见缓解 ,复查胸片示病灶无明显吸收。患者既往体健 ,无饲养鸽、猫、狗等宠物史。体检 :体温 38.5℃ ,血压 15 0 / 90mmHg ,脉搏 10 0次 /min ,呼吸频率 2 4次 /min。营养良好 ,全身皮肤粘膜未见黄染、瘀点、瘀斑 ,浅表淋巴结未及肿大。唇无紫绀 ,颈软 ,气管…     

宏基因二代测序技术对非结核分枝杆菌感染病原学诊断的价值

目的:探讨宏基因二代测序(metagenomic next-generation sequencing,mNGS)技术对非结核分枝杆菌(non-tuberculosis mycobacteria,NTM)感染病原学诊断的价值。方法:回顾性选取2018年9月至2019年12月复旦大学附属中山医院感染病科收治的疑似NTM感染患者183例,共计样本388例,比较常规微生物培养法和mNGS技术对NTM病原体的检出率差异及不同样本类型的亚组分析。结果:常规微生物培养法和mNGS总体检测阳性率差异无统计学意义(21.9%vs 24.7%)。痰液样本培养法的阳性率明显高于mNGS(56.6%vs 22.9%,P0.000 1),而组织样本却低于mNGS(7.8%vs 27.8%,P0.000 1)。另外,mNGS对患者抗菌药物调整频率低于培养法(20.3%vs 40.2%,P0.05)。结论:mNGS对NTM灵敏度较低,需重点改进以促进此技术更好地应用于临床。     

抗革兰阴性菌的新药临床研究进展

耐药革兰阴性菌（Gram-negative bacteria, GNB）的治疗难度大,对人类健康构成巨大威胁。GNB主要病原体包括产超广谱β-内酰胺酶、产头孢菌素酶和耐碳青霉烯类细菌,其中,耐碳青霉烯类的鲍曼不动杆菌、铜绿假单胞菌和肠杆菌科细菌感染者最难治疗。近年来,国际上研发了多种具有抗GNB活性的抗生素。本文对10种新型抗生素进行综述,包括替莫西林、头孢地尔、头孢洛扎/他唑巴坦、头孢他啶/阿维巴坦、头孢吡肟/enmetazobactam、美罗培南/韦博巴坦、亚胺培南西司他丁/雷巴坦、氨曲南/阿维巴坦、依拉环素和普拉佐米星,介绍其作用机制、抗菌谱和潜在不良反应,并结合最新的医院获得性肺炎/呼吸机相关性肺炎（hospital-acquired pneumonia/ventilator-associated pneumonia, HAP/VAP）、腹腔感染（intra-abdominal infection, IAI）和复杂性泌尿道感染（complicated urinary tract infection, cUTI）的临床研究,总结其适应证及临床潜在应用范围。