蛋白酪氨酸磷酸酶1B抑制剂的分子对接及三维定量构效关系研究

目的对文献报道的一系列芳环取代噻唑类蛋白酪氨酸磷酸酶1B(PTP1B)抑制剂进行分子对接及三维定量构效关系(3D-QSAR)研究。方法应用Surflex-Dock进行分子对接结合模式研究,并用比较分子力场分析(CoMFA)和比较分子相似性指数分析(CoMSIA)方法进行三维定量构效关系研究,建立具有良好预测能力的3D-QSAR模型。结果对接结果表明,该类结构可以很好地占据PTP1B的3个关键结合位点,大大提高了抑制剂与酶的亲和力。所建立的CoMFA模型交叉验证系数q~2为0.644,CoMSIA模型交叉验证系数q~2为0.719。结论获得的CoMFA和CoMSIA模型具有可靠的预测能力,可应用于指导该类化合物的设计。     

基于TCGA数据分析线粒体溶质载体SLC25A39在肝癌中的表达及其临床意义

目的：利用癌症基因图谱（TCGA）数据探讨线粒体溶质载体SLC25A39在肝细胞癌（HCC）中的表达及其临床意义。方法：从TCGA数据库下载HCC样本和正常肝组织的RNA-seq数据及临床信息，利用相关R语言软件包分析SLC25A39在HCC中的表达情况及其与临床病理指标、预后及免疫细胞浸润的相关性，并评估其在HCC中的诊断价值。结果：与正常组织相比，SLC25A39在HCC组织中表达上调（P<0.001），其表达水平与肿瘤T分期、病理分期、肿瘤状态、肿瘤残留、组织学分级及AFP水平显著相关（P<0.05）,Cox回归模型分析显示SLC25A39高表达，是影响HCC患者总生存期（OS）的独立危险因素（HR=1.752,P=0.017）。肿瘤免疫细胞浸润分析显示，SLC25A39与中性粒细胞、CD8+T细胞、中央记忆型T细胞（Tcm）、GammaDelta T细胞（Tgd）、Th2细胞和CD56bright NK细胞的浸润水平显著相关（|Spearman’s r|>0.2,P<0.05）。ROC曲线分析显示SLC25A39表达水平对HCC的早期诊断和预后均具有良好...